明代李時珍(東壁)成書於嘉靖三十壹年(1552)至萬歷六年(1578)，三次改稿。
這本書是以“循綱”的文體寫成的，所以取名《綱》。以《證本草》為藍本進行修改。序言(卷1，2)相當於總論，敘述本草的主要參考文獻和藥性理論。
卷1《歷代本草》介紹了明朝以前的主要本草41種。第二遍收集了明代以前關於藥物陰陽氣味、五味禁忌、標本陰陽、盛衰、補瀉、引經據典、各種用藥禁忌的論述，其中以金元時期居多。
第3 ~ 4卷為“百病指示藥”，沿用了《證型本草》中“百病通用藥”的老例，以病原體為綱，列出了適應癥的名稱和主要功能，相當於壹本臨床用藥手冊。
第5 ~ 52卷為諸論，共收藥1892種，附圖為1109種。它的壹般例子是“三個產品之間沒有區別，但壹個接壹個；物以類聚，目以綱。
其中16系(水、火、土、石、草、谷、菜、果、木、器、蟲、鱗、媒、禽、獸、人)作為60類計分。
按照“從微到巨”、“從卑微到昂貴”，每個部門都方便搜索，體現了生物進化發展的思想。該部下有60個類別，許多同科同屬的生物常常被安排在每個類別中。每種藥物都標註為綱，列為目的，即壹種藥物有以下八項(即“物”)。
其中，“史明”列舉別名，說明命名的意義；“集中解決方案”介紹了藥物的生產、形態和收集；《辨疑》(或《是非》)，收集各派學說，辨正藥物疑誤；“秀智”指的是燒制的方法；“聞”、“主治”、“發明”講解藥性理論，提示用藥要點，並給出每位作者的個人見解；“附方”是指疾病，並列出了相關的處方。
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