真菌界分為7個門。
2008年出版的《真菌詞典》第10版，收錄了2001年～2008年之間的研究成果，對第9版的分類系統做了很大的調整。***分成七個門：壺菌門、芽枝黴門、新美鞭菌門、球囊菌門、接合菌門、子囊菌門、擔子菌門，底下分為36綱、140目、560科、8283屬、97861種。
真菌主要的門是由其生殖結構上的特征來分類的。
擴展資料真菌界門的介紹
1、壺菌門
壺菌門真菌稱為壺菌，是真菌界中唯壹在生活史中的某些階段產生能動細胞的成員。壺菌多水生，大多腐生在動植物殘體上或寄生於水生植物、藻類、小動物和其他真菌上，少數寄生於高等種子植物上。大多數種類能分解纖維素和幾丁質。
2、新美鞭菌門
新美鞭菌門的真菌為Orpin於1975年首次根據綿羊的瘤胃中發現的運動細胞所描述。盡管這些細胞最初被認為是鞭毛蟲，現在已經證明它們是與核心壺菌有親緣關系的真菌。在此之前，人們只知道瘤胃的微生物群落由細菌和原蟲組成。
自發現之後，已經從50多種食草動物——包括反芻動物、非反芻哺乳動物和食草爬行動物——的消化道中分離出這類真菌。
3、球囊菌門
球囊菌門（學名：Glomeromycota，AM fungi），又稱聚合菌門、銹球菌門，是真菌界的七個門之壹，目前約已發現400種生物。
球囊菌門的菌絲體是多核的，通常采用無性生殖，在菌絲的末端產生直徑約80~500微米的孢子。在某些情況中，孢子生成後會進壹步形成球囊狀的構造（saccule）。
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