日中辭典的排列方式是以字、詞的「假名拼音」排列，所以熟記五十音的排序，有助於字典的查閱。
如要查「私」わたし（我）時，可先翻到「わ」的部份，接著找「た」，最後再找「し」，只要按圖索驥， 壹路找下去，您就可以找到「わたし」及「わたし」相對的漢字「私」。
日文辭典中假名的排序依次為：清音→濁音→半濁音（如：は→ば→ぱ）。當單字中有促音、拗音及ィ、ゥ、ォ等小字的假名時，仍以壹般順序來排列。如查「あさって」時，只要依あ→さ→つ→て的順序來找，您就可以發現原來這個字就是「明天」的意思。
壹般的日中辭典裏，仍會將較常見的外來語列出來，排列時，不以平假、片假名區分，按發音順序排列，當平假名和片假名同時出現時，以平假名為優先。
二、中日辭典的查法
中日辭典的編排方式和壹般的中文字典壹樣，查閱方式也是先查部首，待找到正確的頁數後，再由漢字剩下的筆劃數查到正確的位置，日本和中國壹樣都是使用漢字的國家，所以查的方式是壹樣的。當您只知道漢字寫法，卻不曉得它的「註音假名」時，查中日辭典是較簡便的方法。
三、外來語辭典的查法
日語中有不少直接取自各國語言的發音，成為日語的壹部份，我們稱之為「外來語」，壹般是以「片假名」書寫，查閱方法和日中辭典壹樣。外來語辭典壹般均附有原文單字及出處，但外來語中的長音「－」，排列時不計，如查「スピーカー」時只，只要按照ス→ピ→カ的假名順序，您就能順利找到speaker（說話者、揚聲器）的意思。
以上是壹般日文字典的查法，此外，還有各種專業或主題字典（如慣用句辭典），查法幾乎都和日中字典查法壹樣。請參各字典的使用說明。