為了確認是不是我記錯了，我特地查了壹下工具書。湖北辭書出版社和四川辭書出版社合著的《漢語大字典》基本涵蓋了所有古代主流辭書。其中對“熊”的解釋有三條，壹是獸名，二是古州名，三是姓（1992縮印本932頁）。根本沒收表示怯懦的意思。《漢語大詞典》中倒有兩個解釋與此相關：“3.斥罵。 菡子 《泉水邊》，‘他擡起頭看了我壹眼，那眼色才看不起我呢，可是他沒有大聲熊我。’《新華月報》1953年第3期，‘有壹次， 沈 竟把我叫到壹邊，熊了我四個鐘頭。’4.軟弱；無能。《中國民間故事選·智殲邵本良》，‘可他碰上 楊靖宇 將軍就熊了。’ 陳登科 《活人塘》十五，‘人熊被人欺，馬熊被人騎。’”所引用的都是現當代的語料。《漢語大詞典》遴選語料時會盡量找到相關的最早的語料的。由此基本可以得出結論，至少在漢語北方官話中，用“熊”來表示“軟弱無能”的意思，是近現代才發生的事情。
那麽“熊”究竟是怎麽發生了這樣的逆轉呢？這個問題我沒有研究，不敢說回答，只能根據語言的壹般規律給出壹個猜想。我個人猜想，這裏的表示怯懦的“熊”來自方言，跟動物的“熊”只是發音上偶合，記錄這個發音時就借用了“熊”這個字，其實食肉目熊科動物“熊”毫無關系。語言學上看，這是兩個不同的詞，只是因為發音相同，而且在漢字中借用了壹個相同的字來記錄這個發音，所以引發了誤會。類似的例子在中文中多得不勝枚舉。比方說“狼狽”就是壹個連綿詞，舊《辭海》上說它是什麽狽前腿短要搭在狼身上才能走路，還有小學語文參考書說是狼騎在狽的背上合作偷羊（孝敬紅太狼麽？）雲雲，其實都是亂講。這個詞本來有“{足真}{足貝}”等寫法，大概是瘸腿行動不便的意思，跟兩種動物毫無任何關系（據慧琳《壹切經音義》）。再舉個跟動物有關的成語“首鼠兩端”，“首鼠”也是連綿詞，耗子只是無辜躺槍的受冤枉者。至於“熊”這裏具體因為什麽方言躺著中槍，我對方言學壹竅不通，並不了解。我猜想可能是從方言詞語“熊包”衍生而來的，也可能是從《漢語大詞典》的解釋3“斥罵”這個意思衍生而來的。這個有待方家考證了。但不管怎麽說，憑我個人的經驗看，我至少有95%的把握認為，它跟表示動物的“熊”，沒有任何關系。
補充：根據@松平千楓齋 提供的材料，楊琳老師《訓詁方法新探》中談到了這個詞。正如許多網友猜想的那樣，這個詞來自方言中的某個不太文雅的說法。楊老師是小學方面的專家，他的考證應該是很可信的。我現在手頭恰好沒有這本書，明天把相關內容抄下來貼在這裏作為補充。在此對@松平千楓齋 表示感謝。此外感謝@Tin_Oxide 提醒我輸入錯誤。感謝@碼字劍 提醒我原來舉例有錯。原來我在“狼狽”處舉例為“空穴來風”，稱“空穴”是連綿詞（說據段玉裁《說文解字註》），跟“空洞的洞穴”沒有關系。經指正，我重新查了《段註》，確認“空穴”的確是連綿詞，但只是跟“空”無關，合起來還是表示“洞穴”的意思的。這壹處是我記錯了。為了例子的生動性，現撤換該例子，另換為“狼狽”壹例。再次對以上諸位表示感謝。
再補充標準答案。楊琳老師《訓詁方法新探》中確實對此問題給出了標答，感謝松平千楓齋。以下為引文，據商務印書館2011版，123頁，有刪節。以下這段文字的版權不屬於我，如需引用請務必註明出處。大括號是打不出來的字的各部分。中括號裏的內容是我加的。
“熊”有軟弱無能的意思。陳登科《活人塘》十五：“人熊被人欺，馬熊被人騎。”罵人話有“熊包”、“熊樣”。熊在漢語中自古以來是勇猛的象征。如《尚書·牧誓》：“尚桓桓，如虎如貔，如熊如羆。”漢陳琳《武軍賦》：“沖鉤競進，熊虎爭先。”元紀君祥《趙氏孤兒》第三折：“老元帥！我有熊心豹膽，怎敢掩藏著趙氏孤兒？”怎麽會有軟弱的意思呢？有些人認為是“倯”的借字。[原註：參見許寶華、宮田壹郎主編：《漢語方言大詞典》，第4914頁]，此說不可信。[按：以下從語言學角度論證其為何不可信，略。]我們認為其本字應該是“{屍從}”（字亦作“{骨泉}”），本義指精液，精液有膿軟的特點，故用來罵人軟弱，正如也用“膿包”罵人軟弱壹樣。《西遊記》第四回：“猴王笑道：‘膿包，膿包！我已饒了妳，妳快去報信，快去報信！’”“熊”在有些方言中也用於指精液（如吳方言）[原註：參見《漢語方言大詞典》，第6971頁]，這進壹步表明其軟弱無能義是精液的引申。