菌有2個讀音
1讀jūn，名詞，表示某些低等生物，以寄生或腐生方式攝取營養，如細菌/黏菌/真菌等。 可組詞為菌落（jūnlùo)
2讀為jùn，名詞，方言指蕈(xùn),可組詞為菌子（jùnzi)
好多人要把"菌"讀成第四聲，首先有這個讀音，而且是個方言，而這個方言形式的讀音在第5版也就是最新版的漢語字典裏是編有的，所以作為常用語言，也不用見怪。
問題補充：細菌的菌
首先1個原因是話音夾方言，比如柳州話，細菌讀成（Xí ，G u yún）這個拼起來讀。而當我們（Xí ，G u yún）以轉成普通話，菌就成的第4聲。
第2個原因就是習慣把地道的方言轉成普通話來硬生生的講，有時不單是音調錯，連讀的字也成的 諧音，比如把柳州話的人（讀“吟”）轉成普通話就叫“銀”。
第3個原因就是聽著聽錯 jūn jùn ，本來音就挺象，或是本來就弄錯了讀音，可能是記錯，也可能是說周圍弄錯的人多了，受錯誤思路汙染的人也多了，認為讀第四聲的人卻“糾正”讀第1聲的，而質疑時其他人都否認，於是都將錯就錯了。
所以以字典為輔更有助於我們 正確而有效的學習。