新版藥典新增加了4個中藥安全性相關的指導原則；增修訂了7種與安全性相關的檢測方法。
2010版的基礎上，部分中藥材及飲片品種的標準中分別增加了二氧化硫殘留、重金屬及有害元素、農藥殘留、黃曲黴毒素等檢測項目。