壹般來講如果表示動物的性別時多數用公母來區分，比如公雞、母雞，公狗、母狗，不僅僅是家畜，野生動物也如此比如公象、母象，公虎、母虎。而在表示植物的性別時多用雌雄，比如雄花、雌花，雄蕊、雌蕊。
語言的形成是壹個漫長的過程，我理解為什麽會用公母來區別動物的性別，而用雌雄來區別植物的性別，主要是因為絕大多數動物不同性別的是以獨立個體存在的，並不需要專門的詞匯來形容它們的生殖器官，只要用壹個獨立的詞來形容就可以區別其性別。而人們日常所見到的高等植物大多都是雌、雄同花或雌、雄同體，只能用壹個詞匯來表示出植物的名字，再用雌、雄來區別它們的生殖器官，比如前面提到的雌花、雄花，雌蕊、雄蕊。在植物界如果雌雄異株，比如銀杏樹等區別雌雄時，有的地方叫做公樹、母樹，也有的的地方叫做雄樹、雌樹。
當然在生物學的書面用語上，壹般都壹雌、雄來區分性別。
具體到妳所說的公雞母雞的區別是什麽，應該和男人和女人的區別是壹樣的。呵呵呵......