獲得患者樣本後，有必要盡快對其進行檢測。需要運輸的樣品不能立即檢測的，應當按照說明書的要求低溫包裝，送專門的檢測機構檢測。檢測機構收到樣品後，應當從樣品中提取核酸，核酸提取試劑應當使用批準的產品說明書中規定的核酸提取試劑盒。
病毒RNA需要先逆轉錄成cDNA，再進行擴增和檢測。PCR擴增和檢測應使用批準的產品說明書中規定的熒光定量PCR儀。通過熒光定量PCR獲得的樣本的Ct值可以確定患者樣本中是否含有新型冠狀病毒。
擴展數據:
目前臨床檢測核酸主要是通過咽拭子。流程是指導受檢者用淡鹽水漱口，可以清理口腔內的細菌，然後將標簽貼在標本容器上。
告知受檢者取咽拭子做培養的目的和方法，點亮酒精燈，指導受檢者張口發聲，充分暴露咽喉，用長的無菌棉簽在培養管內以靈敏輕柔的動作擦拭腭弓兩側和咽扁桃體的分泌物，取樣後在酒精燈的火焰上消毒試管口，然後將棉簽插入試管內，塞緊後及時送檢。
核酸檢測作為病原體診斷的重要依據，是目前診斷最重要的依據。例如，對於新冠肺炎目前的檢測，病毒核酸檢測仍然是診斷的金標準。