仙遊位於福建省東南沿海中部,縣域東西寬49公裏,南北長63.4公裏。瀕臨湄洲灣,緊鄰秀嶼港,距省會福州130公裏,距經濟特區廈門153公裏,距莆田市區44公裏,與寶島臺灣省隔海相望。全縣總面積1835平方公裏,占莆田市的44%。境內“七山壹水兩田”,其中山地203.7萬畝,耕地42.6萬畝,林地1.777萬畝,灘塗3085畝。
仙遊山川秀美,氣候宜人。縣城整體地勢順著木蘭溪,西北高,東南低,形成馬蹄形。沿海地區,平原和山區是截然不同的。著名的東西鄉平原是魚米之鄉、糖之鄉,東北角的興泰裏、西北角的仙遊山是著名的珍稀林區。