日本人和韓國人的家譜仍有爭議。總的來說屬於阿爾泰語系，但找不到同源詞。
聲調等附屬成分不能作為劃分漢藏語系的絕對標準。非洲班圖語系的很多語言都有聲調，漢藏語系的很多少數民族語言沒有聲調。此外，古代漢語中是否有聲調仍有爭議。
語系的劃分壹般是基於現有語言特征的比較和基於古代語言復原框架的歷史比較法。
近年來，民族誌基因分析應運而生。