故障是系統無法執行指定功能的狀態。壹般來說，故障是指系統中某些部件的功能發生故障，導致整個系統功能惡化的事件。設備故障壹般具有五個基本特征:層次性、傳播性、放射性、延遲性、不確定性等。
故障處理是在故障檢測和健康監測之後的壹個過程，即確認故障並采取抑制和定位等措施，以確保系統在故障發生後能夠正常工作或降級。
在故障處理過程中，我們首先要確認故障，即確認下層報告的故障與本層檢測到的故障之間是否存在相關性，並判斷故障是由單壹故障引起的還是由級聯故障引起的。
確認故障後，使用故障代碼和數據分析來準確校準故障。在此基礎上，發起系統重構請求，通過系統重構屏蔽故障。
值得註意的是，目前故障處理是通過靜態機制實現的，即預先確定不同級別的故障類型和故障處理方法，並用故障代碼唯壹標識故障類型，當故障發生時，可以根據故障代碼進行故障處理。事實上，並非所有級別的所有故障都可以在地面上靜態確定。
當故障檢測機制已發現故障，但本級無法確定故障的類型和處理方法時，本級將向其直接上級報告故障，依此類推，直到將未確認的故障報告給飛機級。
飛機級是故障處理的最高級別，對未確認故障的處理至關重要，因為系統級的故障處理行為將影響整個系統的正常運行。
對於未確認故障的處理，也建議采用動態故障處理機制，即利用各種數據融合和智能處理算法實時識別故障並采取相應的處理方法。由於動態確定的故障類型和處理方法是事先不可預測的，因此該提案違反了航空電子系統的確定性原則，目前正處於研究階段。