1.碩士畢業論文的正文肯定會有重復，因為論文正文是整個論文最重要的部分，論文的字數也是最多的。有些碩士論文會包含圖表代碼等內容，市面上的論文查重軟件大多不會對這些內容進行查重，也就是不會檢測這些內容是否重復。但是，正文的文本內容將被復制。
2.查重系統壹般會檢查論文的章節，以目錄為準。因此，目錄必須正確，但目錄不會重復。但是，當您撰寫和安排論文時，您還應該確保目錄是正確的，這樣目錄就不會被包括在重復檢查中。
3.整個碩士論文上傳的內容包括摘要、目錄、正文、致謝和附錄等。大部分論文查重軟件都不會對論文中的表格和代碼進行重復，換句話說就是基本會對文字進行重復，當然也不會對目錄、腳註、尾註、參考文獻等特殊部分進行重復。
4.碩士畢業論文上傳到查重系統後，系統會自動識別論文的標題、內容、摘要、關鍵詞、正文、參考文獻和致謝，然後分別檢測這些內容，並與數據庫中的內容進行比對。