1，按是否OTC:分為處方藥和非處方藥，其中非處方藥又分為甲類非處方藥和乙類非處方藥。（註:本分類不考慮中藥和西藥，即中藥既有處方藥又有非處方藥，西藥也有處方藥和非處方藥。有些藥品既可以按照非處方藥管理，也可以按照處方藥管理，這取決於具體的制造商。非處方藥清單由國家食品藥品監督管理局公布。)
2.根據劑型（許多，但不是全部）:片劑、膠囊劑、顆粒劑、散劑、丸劑、植入劑、栓劑、軟膏劑、乳膏劑、糊劑、糖漿劑、滴劑、口服溶液、口服混懸液、口服乳劑、洗劑、漱口液、灌腸劑、搽劑、包衣劑、凝膠劑、貼劑等。
3、按用途分（即適應癥多）:
壹。化學品:
抗感染:各種抗生素、合成抗生素、抗分枝桿菌藥物、抗艾滋病藥物、抗真菌藥物、抗病毒藥物和天然抗感染藥物。
寄生蟲:抗寄生蟲藥。
呼吸:呼吸系統疾病藥物和復方抗感冒藥物。
皮膚:治療皮膚病的藥物。
精神神經類:治療腦血管疾病、精神障礙和神經系統疾病的藥物。
心腎:治療心血管疾病和腎病的藥物。
手術:補充電解質、酸堿平衡、靜脈營養補充、痔瘡、男性生殖系統等藥物。
腫瘤:治療各種腫瘤和血液病的藥物。
內分泌:治療糖尿病和骨質疏松癥的藥物、解熱鎮痛抗炎藥、各種免疫系統調節劑等。
消化:治療胃腸和肝膽疾病的藥物、減肥藥等。
婦科:婦科疾病用藥。
五官:用於耳、鼻、喉、眼等五官。
放射:放射醫學（如造影劑等。).
其他:很難界定其適應癥，包括輔料等。
二、中醫:
兒科:兒科和兒童用藥。
風濕病:治療風濕性疾病的藥物。
呼吸類:治療呼吸系統疾病的藥物和各種感冒藥。
婦科:婦科疾病用藥。
骨科:治療骨折、頸椎病、骨質疏松等疾病的藥物。
皮膚:皮膚病藥物。
精神神經類:治療腦血管疾病、精神障礙和神經系統疾病的藥物。
心血管:治療心血管疾病的藥物。
手術:跌打損傷、痔瘡等各類手術藥物。
腫瘤:治療各種腫瘤疾病的藥物。
內分泌:治療糖尿病等疾病的藥物。
消化系統:肝膽脾胃等消化系統疾病的藥物。
五官:用於耳鼻喉、眼科等五官的藥物。
泌尿生殖系統:治療男科、泌尿科和生殖系統疾病的藥物。
其他:用於血液病和抗艾滋病等免疫系統疾病的藥物，且難以界定其適應癥。
4.按註冊分類:中藥、天然藥物、化學藥品、治療性生物制品、預防性生物制品和藥用輔料。