西部的裕固族語，又稱“堯胡爾語”，屬於阿爾泰語系突厥語族東熊支。有學者認為，西部的裕固語屬於有許多特臺點的古突厥語，並指出它是回鶻文學語言的“迪語”。使用這種語言的部落有三個:雅拉格、賀朗格和西八，主要分布在肅南裕固族自治縣西部，即今天明華區的蓮花鄉和明海鄉、大河區的韭菜谷鄉和皇城區的馬營鄉。
東部裕固族，又稱“恩格爾語”，屬阿爾泰語系東鄉蒙古語族。據研究，它與13世紀的蒙古語接近，並保留了更多古蒙古語詞匯和語音的特征。主要分布在自治縣東部休閑區的樂康鄉、紅石窩鄉、青龍鄉、大河區的紅星鄉以及皇城區的北峰鄉、北集鄉和東灘鄉。
漢語主要為居住在酒泉縣明華區前灘和黃泥堡的裕固族使用。說不同語言的裕固族人也使用漢語作為交流工具。此外，西裕固語和東裕固語都吸收了大量的漢語借詞，涉及的範圍相當廣泛。根據另壹項調查，大河區和皇城區的壹些人會雙語。此外，皇城區有少數人會說藏語。裕固族的祖先曾經使用古回鶻文字，後來，他們失去了自己的文字。現在，他們沒有自己的語言，他們使用漢語。