美國化學文摘（2011）
中國科學引文數據庫（CSCD—2008）
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中國核心期刊（2008）
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中文核心期刊（1996）
中文核心期刊（1992）
該刊被國際國內著名重要數據庫和檢索期刊收錄，促進了國內外學術交流，主要收錄索引哥白尼；；CA（美國化學文摘）；真菌學文摘（美國《微生物學文摘》）；真菌索引（英國“真菌索引”）；植物病理學評論（英國《植物病理學文摘》）；系統真菌學書目（英國《系統細菌學書目》）；德國植物保護文獻目錄；中國科學技術信息數據庫研究所（CJCR）；中國科學院信息中心中國科學引文數據庫（CSCD）；中國學術期刊文摘；中國農業文摘；中國生物學文摘；北京大學圖書館中文核心期刊概覽。