莖由許多環狀骨板組成，常有稱為根卷枝或卷枝的附屬物。莖的固定端展開成圓盤狀，有的呈指形、葉形或錨形，以便固定在海底。海羊牙齒的卷枝集中在中間背板周圍，用於在海底爬行或臨時固定。分支的數量、數目和形狀是海洋牙齒分類的重要依據。
冠包括花萼和腕部。花萼開始時由兩圈骨板組成，每圈有五塊板，1的下壹圈叫底板，1的上壹圈叫口板。之後，口板變成花瓣狀。在兩個環板之間有五個由1環支撐的手腕輻條。具有這種結構的花萼稱為單環花萼。如果1子環底物在底物下再次分化，稱為雙環萼。大部分活著的海百合都是單環花萼。麥冬的花萼不發達，呈圓盤狀，僅可見中背板和輻板。嘴和肛門朝上，凹槽與嘴相連。溝與腕部分開，溝的側面布滿纖毛，可將食物運送入入口，故溝又叫食溝。
手腕數本來是五個，經常分支成多個。所以有1次(原腕盤)，第二次(雙排盤)，第三次(掌盤)。對應分叉點的腕板稱為分叉軸。從1分叉軸到1分叉軸的腕板數常隨物種而異。在描述海百合時，經常用符號來表示腕板的數量和不動關節的位置。比如ⅱBr4(3+4)表示第二次有4塊腕骨板，第3塊和第4塊板之間有不動關節。
手腕兩側有壹系列羽支，交替出現在每個腕關節的壹側。所以除了不動關節的下1關節外，每個關節都有1羽支。羽枝由羽節組成，羽節的數量和形狀在分類中非常重要。描述時常用P，P，…代表1，2，3羽支在不分支的手腕外，P，P，…代表1，2，3羽支在內…(圖2)。P，P，P用來表示第1腕，第2腕，第3腕的羽支。
生殖腺位於生殖羽支內，成熟的生殖細胞將羽支破壁後放入水中，或保持附著在羽支上。胚胎有纖毛，打破卵膜後獲得百合科特有的纖毛環。海百合的幼蟲呈桶狀，故稱瓶狀幼蟲。瓶狀幼蟲進壹步發育成無柄幼蟲。