解剖學是壹門古老的科學。早在史前時代，人們就通過長期的實踐，如狩獵、屠宰動物、戰爭中負傷等，對動物和人體的外形和內部結構有了壹定的認識。石器時代人類聚居區的墻壁上有很多淺顯的解剖圖，古代中國和古埃及都有防腐知識。幾千年前留下的木乃伊(木乃伊)仍然是研究古代史的寶貴財富。
在20世紀，醫學的發展促進了解剖學的深入研究。隨著胸外科、肝臟外科等各種內臟外科的發展，對器官內血管和管道的形態提出了新的要求。CT和超聲斷層成像的應用也對斷層解剖學提出了新的要求；隨著血管縫合技術的改進和顯微外科技術的發展，顯微外科解剖學得以建立。
人體解剖學在不斷發展，特別是近幾十年來，隨著物理學、生物化學等新理論、新技術的發展，多學科的綜合研究，以及生物力學等邊緣學科的建立和發展，解剖學等形態學研究有向綜合學科方向發展的趨勢，單純形態學研究的局面正在改變。