1.環境毒理學和生態毒理學是兩個獨立的學科。主要依據總結如下:
(1)不同的研究對象、類別和目標任務:環境毒理學是以研究環境汙染物對人體健康的危害和防護為核心內容和任務的科學，以保護人體健康為目標；生態毒理學是以研究有毒有害因素特別是環境汙染物對非人類生物(動物、植物、微生物)及其生態系統的危害和防護為核心內容和任務的科學，以保護生態環境為目標。
兩者不僅核心內容不同，而且知識體系龐大，所以獨立開發是必然趨勢；
(2)環境的概念不同:生態毒理學所指的環境是“生物環境”，狹義上是以野生動物為主體的“環境”；環境毒理學所指的環境是“人類環境”，它是以人類為基礎的；
(3)學科不同:雖然兩者都是環境科學和毒理學的分支，但環境毒理學也是環境醫學的分支，生態毒理學也是生態科學的分支；
(4)研究機構不同:環境毒理學的研究主要在醫療單位，尤其是預防醫學單位進行，而生態毒理學的研究主要在生物、生態、環境科學單位進行；
(5)兩者都有各自獨立的學科發展史:兩個學科的早期研究是在同壹時間、同壹起跑線上起步的，其發展史自始至終都是獨立平行的。