活性益生菌中含有多種微生物，包括氨基酸和活性抗菌肽，以及有機酸、維生素、生化酶和還原為分子氧的活性氧，可以補充人體所需的營養，改善體內微生態平衡。服用活性益生菌後，可以改善腸胃功能，加快胃腸道的蠕動，有助於改善大便幹燥或排便困難等癥狀，還可以緩解腹部脹氣和不能快速吸收食物的癥狀。對胃腸功能紊亂或急性胃腸炎引起的大便次數增多也能起到壹定的輔助治療作用。活性益生菌服用後可以抑制腸道菌群，有利於抑制體內有害細菌和致病菌的生長繁殖，提高胃腸道的防禦功能，同時增強自己的食欲。
另外，服用大量抗生素後，可能會殺死腸道內的有害細菌，但也會破壞很多有益菌，所以這個時候可以適當補充活性益生菌，有助於恢復腸道菌群平衡。