第壹種是阿拉比卡豆，世界著名的藍山咖啡和摩卡咖啡幾乎都是阿拉比卡豆。另壹個是羅巴斯塔。羅巴斯塔咖啡樹的原產地在非洲的剛果。不同品種的咖啡豆有不同的風味，但即使是同壹品種的咖啡樹，由於受不同土壤、不同氣候的影響，也有自己獨特的風味。另外兩個物種是:利比裏亞物種和埃塞俄比亞物種。
如果以生物學來劃分咖啡的品種，可以分為阿拉比卡、羅布斯塔和利貝雷卡。阿拉比卡和羅布斯塔是世界上主要的飲用品種，利貝雷卡因產量低或質量差而常被忽視。
壹般來說，阿拉比卡主要用於單品或精品咖啡，羅布斯塔則用於制作速溶咖啡。雖然阿拉比卡可以定義為高級咖啡，羅布斯塔可以定義為二級咖啡，但不壹定要這樣分類，用喜歡的口味來區分更合適。從口味取向來看，美國和日本經常喝阿拉比卡釀造的淡咖啡，而歐洲更喜歡阿拉比卡和羅布斯塔混合制成的濃咖啡。
阿拉比卡:壹種上等咖啡豆，具有壹流的風味和香氣。
阿拉比卡是埃塞俄比亞的代表品種，南非、非洲和亞洲國家也有出產，占世界咖啡產量的70% ~ 75%。阿拉比卡抗病蟲害能力弱，高原地區更適合種植，尤其是1500m以上的高原地區出產的阿拉比卡咖啡豆品質最好。
這樣努力生產出來的品質好，風味、口感、香氣均衡，可以認證為高檔咖啡豆，主要用於單品咖啡或精品咖啡。著名的三種咖啡豆:夏威夷的科納、牙買加的藍山和也門的摩卡，都屬於阿拉比卡品種。阿拉比卡豆外觀黑而窄，被譽為最優質高產的阿拉比卡品種，其特點是甜、酸、香等風味豐富。
羅布斯塔(Robusta):酸味很重，味道很濃。
羅布斯塔原產於非洲剛果，占世界咖啡產量的30%。羅布斯塔有“堅韌”的意思。事實上，這種咖啡樹不僅抗病蟲害，而且可以在任何土壤中生存，甚至可以在野外生長。因此也可以在高溫地區種植，生長速度快，容易栽培，具有價格低廉的優勢，主要用於配豆或制作速溶咖啡的主要原料。印度、非洲、巴西等地出產的壹些羅布斯塔，酸味強烈，咖啡因含量高，口感豐富。
最近有Allabo Busta，和阿拉比卡交配過，口感和香氣都比較優越。
羅布斯塔呈隆起的橢圓形，生豆呈淺棕色或黃褐色，有草綠色和黃色光澤。與阿拉比卡品種相比，口感更香、更淡，具有酸味不明顯、苦味較重的特點。
埃塞爾薩物種
埃塞爾薩是1904才發現的物種。原產非洲查爾斯河谷，果實小，單株產量高，特別是抗旱品種。該產品風味濃郁，微苦，少栽培。
Typica:埃塞俄比亞最古老的本土品種。所有的阿拉比卡咖啡都來自於泰皮卡咖啡。鐵比卡頂葉古銅色，豆體橢圓形或細尖。風味優雅，但體質弱，抗病性差，果實產量低。牙買加藍山、蘇門答臘曼特寧、夏威夷科納等優秀的園豆都屬於鐵比卡。特點之壹是鐵比卡的頂葉是古銅色的。
波旁酒:移植到也門的Tiebica的早期(前咖啡)變種，豆形由細尖變為圓體。1715年，法國將也門摩卡的圓豆移植到非洲東海岸的波旁島(法國大革命後改名留尼汪島)，才取名波旁島。波旁豆於1727年傳播到巴西和中南美洲，英國於1732年將也門摩卡移植到聖赫勒拿島(拿破侖後來被囚禁的地方)。波旁威士忌是用美國上等咖啡杯來衡量的常盛駿。
基因突變體——波旁變異體
波旁點圖:1810年發現於波旁島，豆子由圓變尖，咖啡因含量只有壹半；但量少勢弱，極為珍貴(多為實驗室培育)。
肯尼亞的“SL28”和“SL34”:20世紀初法國、英國傳教士和研究人員在肯尼亞篩選培育的波旁血統，適應了肯尼亞百年高濃度的磷酸鹽土壤，孕育出具有肯尼亞特色的酸精靈；頂級的肯尼亞咖啡來自這兩個品種，但移植到別處就失去了風味。
波旁阿瑪雷洛波旁酒:巴西聖保羅特有的壹種波旁酒。當它成熟時，咖啡果不會變紅，呈橙色。後來發現當地其他波旁衍生品種也有黃皮。
卡杜拉語:
它是20世紀50年代在巴西發現的波旁單基因品種，比波旁產量和抗病性更好，樹更短，采收方便。不幸的是，它遇到了和波旁壹樣的問題——結果過了壹年，波旁豆的風味不相上下或者略差。
但它的適應性更強，可以高密度種植，不需要遮蔭樹，直接暴露在陽光下也能充滿活力，所以它也有壹個名字——“太陽咖啡”。
Kaddoura適合700米的低海拔地區到1700米的高海拔地區，但海拔越高，風味越好，產豆量越少。中南美洲也有各種黃色的Kaddoura，但是風評不如黃波。
卡圖伊:卡圖伊是新世界和卡杜拉的混血兒。