上任之後,維禎覺得自嘉靖誌以後,山西又有50年未修誌書,於是他便“敦請耆儒纂修山西通誌,親加考核”。大約在萬歷四十四年(1616)脫稿後,他便調升南京禮部尚書,誌書未梓。時隔十余年後,由新任山西巡撫祝徽於崇禎二年(1629)作序並付梓,記事止於萬歷四十二年(1614)。後世對該誌的著錄多有失誤:《中國地方史誌叢刊》1982年第6期《日本現存中國宋明兩代地方誌草目》中,寫作“祝徽纂修”;《上海圖書館地方誌目錄》中,著錄“萬歷三十年修”,顯然是錯誤的。
萬歷《山西通誌》計三十卷,分目二十。篇目為:卷壹,圖考;卷二,建置沿革(附疆域);卷三,星野;卷四至五,山川(附渠堰、橋梁);卷六,風俗;卷七,物產;卷八,田賦(附鹽政);卷九,戶口;卷十,祠祀;卷十壹,封建;卷十二,職官(附公署);卷十三,學校(附學院);卷十四,古跡(附陵墓);卷十五,帝王(附聖母、聖後、聖臣);卷十六至十七,名宦;卷十八至二十,人物(附忠孝、義俠、僑寓、列女);卷二十壹至二十三,選舉(附薦辟);卷二十四,武備上(附形勢、邊關、城池、屯田、馬政);卷二十五,武備下(附將士、邊事);卷二十六至二十七,雜誌;卷二十八至三十,藝文。全書約110萬字。
是誌卷壹圖考,有山西省會、太原府、平陽府、大同府、潞安府、汾州、遼州、澤州、沁州凡九幅。誌文各自先敘省,再敘府,旁及所領縣。是誌如同成化、嘉靖二誌壹樣,對軍事防衛仍予特別重視。明朝政府在成化至嘉靖年間多次修長城,僅山西境內就修築了長達910裏的“邊墻”,是誌作了較為具體的反映。
萬歷誌是成化本和嘉靖本的續誌,在篇目編排上,三部誌書大體壹致,是誌的主要特點,是對地理形勢比以前二誌有了更具體的記載,而且許多記錄都為清初顧炎武編纂的《天下郡國利病書》所采擇。如該誌卷二十四·武備上載:“寧武關,堡凡十二,東為大河、為陽防、為朔寧;北為神池、為大水口、為利民;西北為黃花嶺、為土棚、為義井;西為寧文、為二馬營;西南為西鎮。而寧文又實與寧武相為犄角,以扼山西之險。”再如“偏頭關,堡凡十有八,關以東為馬站、為八柳樹、為老營;東北為小營、為水泉;北為峙?、為滑石澗;西為樺林、為樓子營、為羅圈、為楊冕、為唐家會、為五花營、為得馬、為灰溝;南為永興;東南為八角、為長林”等,都被顧炎武所特別珍視。是誌對這些土堡的配置也有詳細的反映,謂“土堡,依山據險而為之……官有廨宇,士有營舍,而倉鯪草場鹹備焉。……百人之堡,千人不能攻。每堡擇才力者為堡長,次者為隊長。堡長得以制隊長,隊長得以制伍眾。每伍十壹名為壹隊,每隊奇正各半。壹方有急,則三方應援。多造火銃、飛炮、佛朗機之類分給堡塞”。這樣的記述不可謂不詳密。可見萬歷誌的資料性是很強的,因而康熙《山西通誌》對該誌給予高度評價,贊曰“信書”。
明崇禎二年(1629)刻本,國內僅山西省博物館藏有完本。北京圖書館藏有殘卷,並有抄配和膠卷。山西省史誌研究院藏有原版復印件和膠卷。