南京中醫藥大學（Nanjing University Of Chinese Medicine），位於江蘇省南京市，是教育部和江蘇省***建的國家“雙壹流”建設高校，是教育部、江蘇省人民政府與國家中醫藥管理局三方***建高校、江蘇省重點建設高校、江蘇省高水平大學建設高校。
是世界衛生組織（WHO）傳統醫學合作中心、國家衛生部確定的國際針灸培訓中心、全國首批博士和碩士學位授權單位、全國古籍重點保護單位、全國中醫師資進修教育基地、國家建設高水平大學公派研究生項目實施高校、國家“特色重點學科項目”建設高校、國家“卓越醫生（中醫）教育培養計劃”改革首批試點高校、國家級人才培養模式創新實驗區、中國政府獎學金來華留學生接收院校，是世界壹流中醫藥大學建設聯盟、長三角醫學教育聯盟創始成員。
學校始建於1954年，是中國建校最早的高等中醫藥院校之壹，歷經江蘇省中醫進修學校、江蘇省中醫學校、南京中醫學院、江蘇新醫學院、南京中醫學院（恢復建制）等歷史時期。
1995年，更名為南京中醫藥大學。2017年9月，南京中醫藥大學入選國家“雙壹流”建設高校。