1、概念不同：
修身養性，修身：使身體健康；養性：使心智本性不受損害。通過自我反省體察，使身心達到完美的境界。
修心養性，修心：使心靈純潔；養性：使本性不受損害。通過自我反省體察，使身心達到完美的境界。
2、方法不同：
修身養性：十法壹、 十法二、 十法三、三重境界、健腦養神、六道等。
修心養性：生活在當下、生活在這裏、停止猜想，面向實際、暫停思考，多去感受、也要接受不愉快的情感等。
3、出處不同：
修身養性出自元·無名氏《博望燒屯》，修心養性出自在元代吳昌齡的《東坡夢》。
百度百科--修身養性
百度百科--修心養性