截至2015年，學院有國家級精品課程12門 ，國家級特色專業3個，國家級教學團隊3個。 國家級精品課程 醫學導論 腫瘤學概論藥理學婦產科學法醫學耳鼻咽喉科學局部解剖學預防醫學兒科學健康評估內科學醫學遺傳學國家級特色專業 預防醫學 臨床醫學基礎醫學國家級教學團隊 團隊帶頭人細胞與分子醫學教學團隊左 伋兒科學教學團隊桂永浩預防醫學骨幹課程教學團隊 姜慶五教學成果 “十壹五”規劃教材 38本
“十壹五”規劃教材精品教材 3本
“十二五”首批規劃教材 17本
全國百篇優秀博士論文 16篇
（截至2014年） 科研獎勵 復旦大學附屬華山醫院朱劍虹教授領銜的“腦組織修復重建和細胞示蹤技術及轉化應用”項目榮獲2014年度國家科學技術進步獎二等獎，中山醫院董健教授領銜的“專家解答腰椎間盤突出癥”項目獲得2014年度國家科學技術進步獎二等獎（科普類）。 2013年底中華醫學獎 序號 等級 項目名稱 主要完成人 主要完成單位 1 二等 川崎病冠狀動脈病變的流行病學、臨床處理及預測指標研究 黃國英 附屬兒科醫院 2 二等 青光眼視網膜神經保護新策略的研究與應用 孫興懷 附屬眼耳鼻喉科醫院 3 三等 硫化氫多靶點心血管保護作用及其“受體”的發現 朱依純 基礎醫學院 4 三等 結核菌持留與潛伏感染的機制及臨床診治 張文宏 附屬華山醫院 5 三等 膽道閉鎖發病機制研究及臨床規範化診斷治療 鄭珊 附屬兒科醫院 6 衛生政策獎 —— 郝模 公***衛生學院 開創性成果 黃家泗教授在中山醫院創建胸外科
沈克非教授完成國內首例開顱手術
石美鑫教授研制成功第壹臺國產人工心肺機
崔之義教授在世界上首創真絲血管成功
楊東嶽教授在世界上首創足趾移植拇指成功
湯釗猷教授提出小肝癌早診早治新概念
黃鶴年教授完成世界首創新喉再造術 館藏資源 復旦大學醫科圖書館創建於1927年，原名國立上海醫學院圖書館，1959年改名為上海第壹醫學院圖書館，1985年5月易名為上海醫科大學圖書館，2000年4月27日上海醫科大學與復旦大學合並，改成現名復旦大學醫科圖書館。
復旦醫科圖書館藏書刊40余萬冊，重點收藏基礎醫學、臨床醫學、藥學、預防醫學、法醫學、護理學等領域的中英文書刊。校園網用戶通過復旦醫科圖書館主頁可檢索訪問中國生物醫學文獻數據庫(CBM)、中國學術期刊網絡出版總庫、中文科技期刊數據庫、萬方數據知識服務平臺、Web of Knowledge、EMBase、Proquest、OVID醫學全文數據庫、EBSCO的Academic Search Elite、Elsevier的ScienceDirect、Kluwer等200多種數據庫。學術資源門戶MetaLib/SFX提供跨庫檢索和電子期刊全文查詢鏈接。
復旦醫科圖書館是中國高等院校醫學圖書館協會副主任委員館，是全國高等院校醫學圖書館資源***享協作網華東地區中心館，是全國醫學文獻檢索教學研究會名譽理事長和副理事長館，是CALIS醫學中心主要成員館。 學術期刊 《復旦學報（醫學版）》：由教育部主管、復旦大學主辦的向國內外公開發行的綜合性醫藥衛生類學術性核心期刊。其前身是《上海醫科大學學報》，創刊於1956年6月。主要刊登基礎醫學、臨床醫學、藥學、預防醫學等領域的以原創性研究為主的論文。
《中國眼耳鼻喉科雜誌》：由教育部主管，復旦大學附屬眼耳鼻喉科醫院主辦的全國性專業學術期刊，是中國科技核心期刊（中國科技論文統計源期刊）、復旦大學核心期刊。主任委員王正敏，主編孫興懷、遲放魯。已被萬方數據、中國知網及重慶維普數據庫全文收錄。
《中國循證兒科雜誌》：由教育部主管，復旦大學主辦的兒科專業學術技術類期刊，主編桂永浩。雜誌為雙月刊，全年***發7期(包括增刊1期)。刊發論著42篇，專家對談錄7篇，講座2篇，綜述10篇，病例討論2篇，病案報告7篇。
《中國臨床神經科學》：主編蔣雨平。是由教育部主管，復旦大學附屬華山醫院、復旦大學神經病學研究所主辦的醫藥衛生類科技期刊。2000年起為中國科技論文統計源期刊、中國學術期刊綜合評價數據庫等5家期刊數據庫收入並評為中國科技核心期刊。
《中國醫學計算機成像雜誌》：(Chinese Computed Medical Imaging) 名譽主編陳星榮，主編沈天真。該刊由教育部主管，復旦大學上海醫學院和復旦大學附屬華山醫院主辦。編輯部日常工作由復旦大學附屬華山醫院負責。雜誌為中國科技期刊、中國學術期刊（核心期刊）。
《中華手外科雜誌》：主編顧玉東，是中華醫學會主辦的手外科專業學術期刊。雜誌已加入中國科學引文數據庫（CSCD）、中國學術期刊綜合評價數據庫、中國期刊全文數據庫、中國數字化期刊全文數據庫、中文科技期刊數據庫。
《中國臨床醫學》：雜誌主編楊秉輝。該刊系教育部主管復旦大學附屬中山醫院主辦的臨床醫學類學術期刊，為中國科技核心期刊，中國科技論文統計源期刊，中國科學引文數據庫來源期刊。被中國期刊全文數據（CJFD）、萬方數據庫數字化期刊全文收錄；被國家圖書館、中國版本圖書館、上海圖書館等全文收錄。
《中國癌癥雜誌》：主編沈鎮宙。該刊是由教育部主管、復旦大學附屬腫瘤醫院主辦的全國性腫瘤學術期刊。被“中國期刊網”、《中國學術期刊（光盤版）》全文收錄；入選 “中國學術期刊綜合評價數據來源期刊”；加入“萬方數據庫―數字化期刊群”全文上網，被《中國核心期刊（遴選）數據庫》收錄；被北大圖書館《中文核心期刊》收錄為中文核心期刊。