1949年中華人民***和國成立後，中華書局、商務印書館、開明書店、三聯書店組建中國圖書公司，1954年圖書公司又並入新華書店。魏隱儒隨之調轉，有機會飽覽了大量古籍善本，積累了大量的資料和經驗，並將經驗和心得整理成文。尤其是1957年中國書店成立以後，魏隱儒被調去編輯《古舊書刊介紹》，以向學術界推薦古舊書刊，並負責古舊書刊收售價格的制定工作。這些工作對於他研究罕傳善本古籍大有裨益。他對親自過目的傳世稀少的珍本圖籍，都作了詳細記錄，有的還拍攝書影，積累資料數十萬言，對古籍雕刻之研究頗多心得。從事古籍版本研究數十年，曾為北京大學古籍研究所碩士研究生班、杭州大學古籍研究所碩士研究生班傳授“版本學”。這期間他有多部著作問世，如:《古籍版本知識》、《中國古籍印刷史》、《古籍版本鑒定叢談》、《印刷史話》、《藏書家考略》、《古籍裝訂修補知識》、《現代文史資料所見錄》、《書林掇英》等等。其中《古籍版本鑒定叢談》壹書，還由日本橫濱大學教授譯成日文，由東京都東方書店出版，給予了很高評價。
1978年文物管理處改成北京市文物局，魏隱儒負責保管、整理和鑒定工作，直至1981年5月退休。其間曾任中國古籍善本書目編委會分主編，多次參加全國古籍編目等有關座談會，並應邀為國家和各省市圖書館、各大專院校圖書館講課和解決善本收錄、鑒定中存在的問題。