相傳古代用中醫給病人治病，但從來沒有效果。有壹次，病人不小心按到了某個地方，病人的疼痛減輕了。醫生隨後在這個地方四處摸索，病人大叫:“啊，就是這個，就是這個。”醫生給針灸，病程確實好轉了。於是這個特殊的穴位被命名為“阿是穴”。據唐代孫思邈《千女方》:“人有壹痛，有壹說，即捏之，若在正處，不問穴，便成痛處，即雲正。艾灸為考，故雲阿為點。”也就是說，用的時候不壹定要把針貼在穴位上。如果有效，就貼在對的地方，如果能達到效果。這些特殊的痛點被稱為“阿是穴”。
中醫認為阿是穴通過經絡系統與臟腑相連，經絡系統具有溝通內外上下，向全身分布氣血營養的生理功能；病理上也是壹種由表及裏轉移致病因素的方式。因此，阿是穴不僅是治療疾病的最佳刺激點，也是疾病的反射點，在臨床診療中被廣泛應用。