山東大學儒學高等研究院於2012年由原儒學高等研究院、儒學研究中心、文史哲研究院和《文史哲》編輯部整合而成，文史哲研究院名稱保留。原文史哲研究院成立於2002年，是由原文史哲研究所（1978年成立）、古籍整理研究所（1983年成立）、民俗研究所（1985年成立）合並而成。原儒學研究中心成立於2005年。原儒學高等研究院成立於2010年。《文史哲》則創刊於1951年。作為儒學院的源頭和組成部分，上述機構有著***同的人文學術傳承和深厚的學術根基。曾在本院前身機構任職的知名學者有華崗、吳富恒、楊向奎、蕭滌非、王仲犖、關德棟、蔣維崧、王紹曾、龐樸、葛懋春、丁冠之、董治安等。
儒學高等研究院是壹個以古典學術為重心、以儒學研究為特色的綜合性人文科研機構，同時致力於本科生、碩士生、博士生等人才培養。目前設有中國哲學研究所、中國史學研究所、中國文學研究所、經學小學研究所、古典文獻研究所、民俗研究所。現任院長許嘉璐，執行院長王學典，黨委書記李平生，副院長顏炳罡、王加華、徐慶文、王震，黨委副書記李鵬程。