2023年南京市莫愁中等專業學校前三年享受國家補貼免學費，五年壹貫制專科後兩年按文科類理工類、藝術類等專業大類分別收取4700-6800元不等學費。
住宿費按實際住宿條件每學期收取，安國村校區400元/學期；高廟路校區600元/學期。國家現在對與中專學校相關的助學政策，不僅是在就業、升學方面有政策，在學費方面也有政策，對於中專前三年都是免學費，只是會收取壹些住宿費和學雜費。
學校校園優美，設施壹流，是國家級職業技能鑒定所，擁有藥物制劑技術、古籍修復與保護、商貿酒店、移動互聯應用技術等十多個先進的實訓基地。
2016年，學校啟動奧體南部的新校區建設，2019年建成占地63畝、建築面積達6萬平方米的智能化、園林式新校區，非遺學院於2019年11月整體搬入。學校整體架構了壹縱四橫的德育工作體系，建設了全省領先的德育管理信息平臺，實施獨具莫愁特色的人本德育管理。
該校長期堅持“面向市場、提升素質、強化能力、嚴格管理”的辦學理念，註重內涵發展、品牌建設，先後榮獲“江蘇省職業教育先進單位”、“國家表彰綠色學校”、“江蘇省德育先進學校”、“江蘇省教育科研先進集體”、“南京市師德先進群體”等榮譽。
教學條件
該校校園環境優美，設施壹流。教室都配備多媒體教學設備，建有數十個專用實驗室、實習操作室、微機房；建有校園閉路電視系統和計算機網絡系統，學校高度重視實驗。
實訓和實習基地建設，擁有各類實驗實訓基地12個，其中“藥劑”、“古籍修復”為省級職業教育實訓基地，為學生提供了良好的實訓條件。