先秦兩漢是我國灸法的重要形成時期，出現了以《黃帝內經》為代表的大量著作，以及以張仲景為代表的著名醫家。
《黃帝內經》，把灸療作為壹個重要內容進行了系統的介紹，強調"針所不為，灸之所宜"。灸療的作用具有起陷下、補陰陽、逐寒邪、通經脈、舒氣血等多個方面。《皇帝內經》還提到"以火補者，毋吹其火，須自滅也；以火瀉者，疾吹其火，傳其艾，須其火滅也"的補瀉之法。同時，還指出了艾灸的禁忌證：陰陽俱不足或陰陽俱盛者、陽盛亢熱及息積等。《皇帝內經》在壹定程度上奠定了灸法的基礎。
東漢時期，醫聖張仲景在強調藥治的同時，也十分重視灸法。《傷寒論》中涉及灸法的有十二條之多，且重點論述了灸法的禁忌和某些疾病的灸治方法。並提出了"陽證宜證，陰證宜灸"的見解。這些，對後世醫家都產生了重要的影響。
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