（2006年之前）：
（壹）著作
1、《A History of Chinese Entomology 》（英文譯著）天則出版社，1990年。
2、《中國近代昆蟲學史》陜西科技出版社，1995年。
3、《中美農業發展比較研究》中國農業科技出版社，1999年。
4、 中國農業發展史 《農業概論》中國農業出版社1999年
5、《中國近代農業改進史略》中國農業科技出版社，2001年。
6、《中國農業科技史》中國農業科技出版社，2001年。
7、《中國農業古籍目錄》中國圖書文獻出版社，2002年。
8 、《傳統與現實的對話——二十世紀中國農業與農村變遷研究》（主編）中國農業出版社，2003年。
9、《西部農業開發史研究》 中國農業科技出版社 2003年。
10、《二十世紀中國的昆蟲學》世界圖書出版公司2003。
11、An Induced Technological and Institutional Change——the agricultural development in China since the 16th century 《Tradition and Change of Agriculture in East Asia》,p75-92, published by Korea Rural Economic Institute. 2003。
12、《論張謇科教興農及倡導棉鐵主義的實踐》，中華工商聯出版社出版《中國早期現代化的前驅》
13、《二十世紀中國的昆蟲學》（合著），世界圖書出版公司，2004年
14、China’s Entry into WTO and the Agricultural Development: Opportunity, Challenge and Strategy. WTO/DDA NEGOTIATION and AGRICULTURAL POLICY REFORM. Published by Korean Rural Economic Institute. 2004. September
15、《萬國鼎文集》（主編）， 中國農業科技出版社 2005年
（二）論文
1、《美國農業機械化進程及其面臨的問題》,《農業考古》1993年第1期。
2、《中國近代昆蟲學社團》,《中國科技史料》1993.14(2)。
3、《臺灣昆蟲學研究及害蟲防治事業的歷史發展》,《中國農史》1994年第1期。
4、《從美國農業的歷史發展看持續農業的興起》，《農業考古》1995年第1期。
5、《觀念的更新與農史學科的發展》，《農業考古》1995年第1期 。
6、《工業化、城市化與農業變化》，《中國經濟史研究》1995年第3期(人民大學報刊復報告印資料中心《經濟史》專題全文轉載）。
7、《關於農業規模經營的問題》，《中國科技導報》1995年第4期（被收入中國科學院和中國工程院主編的《中國科技文庫》）。
8、Review on Making of A Hinterland : state, society and economy in inland
North China 1853-1937，《Agricultural History》 1995(69):1
9、《傳統農業向現代農業轉變的動力與條件》，《中國農史》1996年第1期。
10、《從歷史傳統看中美生態農業的實踐》，《生態經濟》1996年第6期。
11、《站辦農場——農技服務產業化的新思路》，《中國科技導報》1997年。
12、Sustainable Agriculture in Tai Lake Region of China，荷蘭《Agriculture， Ecosystem and Enviornment》 97。
13、《中美農業合作經濟的發展比較》，《古今農業》1997年第4期。
14、《條件與約束：資源、技術、制度與文化》，《中國農史》1998第1期 。
15、《技術變化下的資源、環境與社會》，《古今農業》1998年第4期。
16、《誘致性技術變遷——談明清以來的中國農業》，《安徽農業大學學報（社科版）》1998年第4期。
17、《比較觀中的中國國情分析及未來中國農業技術的發展戰略》，《農業考古》1999年第1期 。
18、American Crops in Asia Before Columbus Times Pre-Columbiana，1999 。
19、《近代農業生產結構的變化及其動因分析》，《南京農業大學學報（社科版）》2001年第1期。
20、《農史研究：回顧與展望》，《中國農史》2002年第4期（《新華文摘》全文轉載 2003.3)。
21、《美洲作物的傳播及其對中國農業發展的影響》， 《中國農史》2004年第1期。
22、《試論政治因素及政府政策對中國現代昆蟲學發展的影響》（合作）， 《中國農史》2004年第2期。
23、誘致性技術與制度變遷 《中國科學技術回顧與展望》中國科學技術出版社
24、《花生的傳入、傳播及其影響研究》（合作）， 《中國農史》 2005年第1期。
25、《辣椒在中國的傳播及其影響研究》，《中國農史》 2005年第2期。
26、《中國雜交稻發展的經濟、技術與社會學分析》（合作）， 《中國科技論壇》2005年第3期。
研究成果（2006年之後）：
新疆坎兒井的農業文化遺產價值及其保護利用 《幹旱區資源與環境》2012（2）（與崔峰合作）
非物質文化遺產視角下江蘇傳統制茶技術考證及價值探討 《中國農史》2012年第4期（與劉馨秋合作）
農業文化遺產保護面臨的困境與對策 《中國農業大學學報》（社科版）2012年29卷第3期（與李明合作）
江蘇禪茶文化遺產考證 《農業考古》2012年（5）229：234 （與劉馨秋合作）
氣象災害對民國上海地區植棉業影響的比較分析 《中國社會經濟史研究》2012年（3） （與李義波合作）·民國時期長三角棉業組織研究 《中國農史》2012年（3）（與李義波合作）
中國古代農學思想探析 《自然辯證法研究》 2012年（11）（與黃穎合作）
東北人地關系變遷及其規律研究 《社會科學戰線》2012（11） （與李琦珂合作）
東北地區農業系統資源利用方式及其效益的歷史變遷 《東北亞論壇》2012（4）（與李琦珂合作）
農業文化遺產：保護什麽與如何保護 《中國農史》2012（2）（與李明合作）
梁希“大林業思想”探析 《中國農史》 2012 （1）（與胡文亮合作）
中國農業發明創造對世界的影響 《農業考古》 2012（1）26：32
《20世紀中國知名科學家學術成就概覽》（農學卷）（萬國鼎） 科學出版社 2011年第287-296頁 （與陳少華合作）
以國治水，以水知國 ---- 評大衛·艾倫·佩茲《國家工程》 《綠葉》2011年（12）
萬國鼎與中國田制史 《中國田制史》 商務印書館 2011年 387-394
長興茶業歷史發展概述 《農業考古》 2011（5） （與劉馨秋合作）
轉基因主糧商業化爭論的幾點思考 《華中農業大學學報》（社科版）2011（6）（與姜萍合作）
毛澤東“先合作化後機械化”思想探析 《毛澤東鄧小平理論研究》 2011（9）（與張月群合作）
江蘇省民俗類農業文化遺產調查現狀與保護對策研究 《中國農史》2011年（3）（與璐璐合作）
農業遺產研究現狀 《中華農業文化攬勝》 唐珂主編 中國時代經濟出版社 2011年
《農業：文化與遺產》 中國農業科技出版社 2011年
《江蘇農業文化遺產調查研究》 中國農業科技出版社 2011年
《中國農業科技史》 中國農業科技出版社 2011年
《美洲作物在中國的傳播及其影響研究》 中國三峽出版社 2011年
江蘇農業文化遺產保護調查與實踐探索 中國農史2011（1）（李明）
芻議農業高校推進農業文化遺產研究與傳承的對策 中國農業教育2011（1）（胡燕）
近代農民離村原因研究 中國經濟史研究 2011（1）（周應堂）
《科學編年史》（編委） 上海科技教育出版社 2010年12月
《技術：歷史與遺產》 中國農業科技出版社 2010年 （主編）
李約瑟與中國農史學家 《中國農史》2010（4）
明清時期黃淮河防管理體系研究 《中國經濟史研究》2010（3）（與盧勇合作）
張謇“導淮”：中國近代水利史上的壹個轉折點 《華北水利水電學院學報》2010（2） 98-105頁 （與尹北直合作）
轉基因大豆技術發展動因探悉 《中國農學通報》2010（4）342-347頁。（與姜萍合作）
人文勝地，美食天堂------談“四大名吃”之首的南京夫子廟小吃 臺灣《中華飲食文化基金會會訊》2010年 vol 16（1）
《中國農業遺產研究叢書》 中國農業科技出版社 2010年始
《江蘇農業歷史文化研究叢書》 中國農業科技出版社 2010-
李儀祉與江淮水利 《工程研究》2009（4）（與尹北直合作）
The Origin and Production of Rice and Their Impacts on Social Development of China. Rice, Life & Civilization. Korea. 2009 Vol.3 ·中國的農業遺產研究：進展與變化 《中國農史》2010（1）
“無鴨不成席”----- “鴨都”何以成為南京的代名詞？中華飲食文化基金會《中華飲食文化研究叢書》
《民以食為天·地方飲食文化》（二）（黃克武主編）2009 45-68頁。
美洲作物的傳播及其對中國飲食原料生產的影響 中華飲食文化基金會《中華飲食文化研究叢書》
《飲食傳播與文化交流》（蒲慕州主編）2009 125-160頁。
明清時期淮河水災預防措施探析 《中國農史》2009（3）（與盧勇合作）
《美洲陸地棉的引種、推廣及其影響研究》《中國農史》2009年2期（與羌建合作）
農民離村問題研究 《中國經濟史研究》2009（3）（與周應堂合作）
非理性群體行為中的個體理性分析《中國青年研究》2009（76-79）（與吳磊合作）
中國傳統稻魚***生系統的歷史分析 《中國農學通報》2009（5）：245-249。（與夏如兵合作）
李儀祉對中國傳統堤防理論的繼承與發展 《中國農學通報》2009（5）：294-299頁。（與尹北直合作）