1604年，外科學家申鬥垣撰成《外科啟玄》，他對外科鼻祖——華佗的外科手術未能傳世深表惋惜，故以“啟玄”為其書名，旨在發掘歷代外科手術療法與醫療技術，以為民造福。他提倡外科疾病的預防和早期治療，在外科學發展上是富有特點的。例如在敘述筋瘤的治療時強調“以利刀去之”，不要延誤時日。對血瘤，他主張“以利刀割去，銀烙匙燒紅壹烙止血，不再生”，也有早期治療之意。而在淋巴結結核的治療上，則明確反對亂施刀針手術，批評手術切除淋巴結核的醫生“如割韭相同”，只“取其標而未治其本”。外科手術器械之消毒與否，對外科手術取得成功是至關重要的，申氏與同時代的眼科學家博允科對此十分重視。他們強調：煮針壹法，《素問》本無，今世用之，有益而無害，故從之。這是外科消毒觀念建立的重要壹步。申氏還強調：“古有以口吮膿之德，今則以壹端留節削去青皮之薄竹筒，藥煮十數沸，乘熱安瘡上，膿滿自落法吸膿，如此至膿盡，膏藥貼之，以防擠壓而有形成胬肉突出久不收口之患。”這既是吸膿法之改進，也是消毒法之新進展。