《四庫全書》分經、史、子、集四部分、，又稱“四庫”。部下有類，類下有屬。全書***4部44類66屬。經部收錄儒家“十三經”及相關著作；史部收錄史書；子部收錄諸子百家著作和類書；集部收錄詩文詞總集和專集等。《四庫全書》的分類法是中國古代最具代表性的圖書分類法之壹。
經 部
《易經》 《尚書》 《詩經》 《周禮》 《儀禮》 《禮記》《大學》 《中庸》 《孟子》 《論語》 《孝經》 《爾雅》《春秋左傳》 《春秋公羊傳》 《春秋谷梁傳》
史 部
《國語》 《史記》 《漢書》 《晉書》 《宋書》 《梁書》《陳書》 《魏書》 《周書》 《隋書》 《南史》 《北史》《宋史》 《遼史》 《金史》 《元史》 《明史》 《史通》《戰國策》 《後漢書》 《三國誌》 《南齊書》 《北齊書》《舊唐書》 《新唐書》 《列女傳》 《越絕書》 《水經註》 《島夷誌略》《舊五代史》 《新五代史》 《吳越春秋》 《風俗通義》 《華陽國誌》《建康實錄》 《貞觀政要》 《資治通鑒》 《天工開物》 《東周列國誌》
子 部
儒家：《荀子》 《說苑》 《帝範》 《政訓》 《潛書》 《新序》 《鹽鐵論》 《潛夫論》 《近思錄》 《郁離子》 《傳習錄》 《呻吟語》《孔子家語》 《溫公家範》 《袁氏世範》
兵家：《孫子兵法》 《吳子》 《司馬法》 《尉繚子》 《孫臏兵法》 《六韜》《三略》 《握奇經》 《素書》 《將苑》 《李衛公問對》 《虎鈐經》《守城錄》 《練兵實紀》 《紀效新書》 《何博士備論》
法家：《管子》 《商君書》 《韓非子》農家《齊民要術》 《農桑輯要》
醫家：《黃帝內經》 《神農本草經》 《黃帝八十壹難經》 《洗冤集錄》
數理天文類 ：《周髀算經》
集 部
《楚辭》 《詩品》 《曲品》 《南戲》 《花間集》 《柳永詞》《晏殊詞》 《東坡詞》 《秦觀詞》 《放翁詞》 《姜夔詞》