（1）新的中醫藥科學技術成果－－中醫預防、臨床（含中醫臨床經驗總結，民間單、驗、秘方，壹技之長與特殊療法的發掘、整理），中醫基礎理論，中藥，中醫護理及文獻的整理、研究等方面；
（2）推廣、應用已有的中醫藥科學技術成果；
（3）中醫藥器械、儀器、設備的研制；
（4）引進、消化、吸收、開發、應用國外先進技術；
（5）技術基礎工作（如標準、計量、科技情報、科技檔案等）；
（6）為決策科學化和管理現代化而進行的軟科學研究。第三條 凡申請本獎勵的項目，不得同時向國務院其他部、委、局申請部、委級獎勵。凡已獲得國家級和其他部、委、局級科技進步獎勵的項目，不得再申報本獎勵，對重復申報的項目，予以撤銷。第四條 本獎勵要求按下列三個條件進行綜合評定：
（1）科學技術水平和技術難度（指先進程度、創新程度與難易程度或復雜程度）；
（2）社會效益或經濟效益（包括直接的與間接的）；
（3）推動中醫藥科技進步的作用（指實用程度或推廣、應用程度及其意義）。
壹等獎項目應達到同類項目的國內或國際的領先水平，技術難度大，推動中醫藥科技進步作用大，並取得重大的社會效益或經濟效益。
二等獎項目應達到同類項目的國內先進水平，技術難度較大，推動中醫藥科技進步作用明顯，並取得比較大的社會效益或經濟效益。
三等獎項目應是同類項目的國內較先進水平，有壹定技術難度，推動中醫藥科技進步作用比較明顯，並取得比較大的社會效益或經濟效益。第五條 具備以下條件之壹，可申報中醫藥科學技術進步獎。
（壹）新的中醫藥科學技術成果，屬於：
1．國內或國際首創的；
2．本行業先進的；
3．經過實踐證明具有較大社會效益或經濟效益的。
“國內或國際首創”是指某項科學技術成果，在國內或國際上首次研制成功的，並首次應用於中醫藥實踐的，同時依據科學技術成果管理規定首次登記的，或雖未登記，但也未曾在國內刊物上公開發表過的；或與公開的類似科學技術成果有本質的差別的。
“本行業先進”是指某項科學技術成果已實現的綜合技術經濟指標，超過了國內已公開的同類技術的先進水平。
“經過實踐證明具有較大社會效益或經濟效益”是指某項科學技術成果經過中醫藥醫療實踐、預防實踐、生產實踐或科學試驗證明，確實有較大社會效益或經濟效益。社會效益壹般指在醫療、預防、教育、科研等方面，應用後的意義、價值和效果。經濟效益是指已取得的直接（壹次）累計凈增經濟效益、年均凈增經濟效益（兩者同時列出）和間接或潛在的經濟效益。
（二）在組織、實施推廣、應用已有的中醫藥科學技術成果中，做出了有效的工作或創造性貢獻，並取得了較大的社會效益或經濟效益。
（三）研制應用於中醫藥工作中的器械、儀器、設備；或在設計、生產過程中采用新技術，並取得了較大的社會效益或經濟效益。
（四）在引進、消化、吸收、開發、應用國外先進技術中，做出了創造性貢獻，並取得了較大的社會效益或經濟效益。
（五）在標準、計量、科技情報、科技檔案等技術基礎工作中，進行了創造性勞動，取得了國內較高水平的成果，效果顯著，有較大的社會效益或經濟效益。
（六）在為決策科學化與管理現代化而進行的有關戰略、政策、規劃、評價、預測、科技立法及有關管理科學與政策科學的軟科學研究中，做出了創造性貢獻並經實踐證明取得了顯著的綜合社會效益。第六條 國家中醫管理局中醫藥科學技術進步獎分為下列三個等級。
獎勵等級 榮譽獎勵 獎金
壹等獎 國家中醫管理局中醫藥 5000元
科學技術進步獎證書
二等獎 國家中醫管理局中醫藥 3000元
科學技術進步獎證書
三等獎 國家中醫管理局中醫藥 1500元
科學技術進步獎證書