人員
在崗職工107人。專業技術人員91人，其中高級職稱人員31名，中級職稱人員28名，內蒙古自治區名蒙醫3名，內蒙古自治區名中醫1名，通遼市名蒙醫4名。
現任領導
所長：齊雙山
黨支部書記、副所長：包光華
副所長：張巴根那
黨支部副書記：梁玉
基礎建設
研究所占地面積7400平方米，建築面積7450平米。2003年至2005年建設科研、門診、病房綜合大樓，2008年按國家GPP標準建設蒙藥制劑室，生產蒙成藥100余種，年生產量3000公斤以上。
開放病床120張。 科研醫療科室
蒙醫文獻資料研究室、蒙醫臨床研究室、蒙藥新藥研究室、蒙醫內科、外科、婦科、兒科等。
專病專科
腎病專科、蒙醫傳統整骨專科、肝胃病專科、心腦血管專科、頸腰椎間盤突出癥專科、蒙醫五療、口腔科、呼吸內科、皮膚科、小針刀專科、肛腸科等。
病房療區
骨科壹療區、骨科二療區、腎病療區、綜合療區和外、婦療區和傳統療術康復中心等。 以蒙醫藥研究為主，科研醫療並舉並重的原則，運用傳統醫學理論和現代科學相結合，開展文獻資料研究、臨床研究、蒙藥研究工作。
繼承、挖掘、搜集、整理了蒙古、藏、漢、維吾爾、滿等5種文字撰寫的醫學古籍12類、184種、545冊，翻譯出版了《索瑪然薩》、《醫學訣竅秘籍》、《炮制名藏》等10余部經典著作，承擔和完成國家中醫藥管理局和自治區科委下達的《蒙藥新藥“保利爾”的研究》、《中華本草·蒙藥專卷》、《蒙藥哈布德仁—9散劑改硬膏劑的研究》、《蒙藥治療萎縮性胃炎的研究》等20余項科研課題。其中10多項分別獲得自治區、市級科技進步壹、二、三等獎。
《蒙醫藥烏拉灸療術》以批準為內蒙古自治區級非物質文化遺產，並已申報國家級非物質文化遺產。
內蒙古自治區衛生廳下達的《蒙藥壯西灰劑治療反流性胃食管炎的臨床研究》科研課題正處於研究階段。 自治區內外的腎病專科、蒙醫傳統整骨專科每年接診來自國內外的近萬名患者。其他科室也各具特色。
每年，門診接診患者30000人次以上，住院2000人次左右。住院病歷甲級率98%以上。門診和病房蒙中藥治療率分別達到70%和60%。入出院診斷符合率95%以上。治愈好轉率95%以上，病床使用率80%左右。 1、加強基礎設施建設，築牢蒙醫藥發展根基。
2、加強專科建設，調整科室結構。
3、加強人才隊伍建設，培養和造就純正的蒙醫藥人才。
4、加強科研工作，爭取獲得更多的科研成果。
5、不斷改善科研醫療設備。