神舟六號的成功發射，傾註了無數科技工作者的心血，艱苦奮鬥、自主創新的精神激勵著廣大科研人員以更飽滿的熱情投身到各自工作中。內蒙古社會科學研究院鄂倫春族研究員白蘭表示：“我國航天科技人員夜以繼日，吃苦耐勞，辛勤工作，他們的精神值得所有科研人員學習，並激勵我們多出原創性成果，不負國家和民族的期望，讓中華民族更加強大。”
祖國航天事業取得的巨大成就和航天人勇攀科技高峰的拼搏精神，成為激勵遼寧公安邊防總隊官兵圓滿完成各項任務的強大精神動力。這個邊防總隊海警各支隊組織大規模的打擊海上偷渡、走私、販毒的實戰演練，在海上陣風5至6級、浪高2米的惡劣海況下，官兵們發揚航天人頑強作戰、不畏艱險的精神，苦練靠幫、跳幫、檢查、押解等本領。
神舟六號圓滿完成飛天任務，極大激發了學生們熱愛科學、獻身科學的豪情壯誌。山東濰坊外國語學校全體師生17日上午舉行了隆重的升旗儀式，同學們在國旗下進行了《祝賀“神六”，為祖國自豪》的演講。隨著升旗班級的合唱《紅旗飄飄》，臺上臺下齊歡歌，***同祝願祖國繁榮富強。江蘇省青少年科技教育協會秘書長楊曙寧說：“神舟六號成功發射之後，江蘇很多中小學掀起壹股科技熱。學生們通過組織航模制作、航天科普繪畫與征文活動，提高科學思維能力、創新能力與動手實踐能力，表示要更加努力地學習，長大後為祖國的科技事業貢獻自己的力量。”
作為飛船的主著陸場，內蒙古自治區各族人民對神舟六號給予更多的關註。17日淩晨3時，在內蒙古電力系統工作的朱勇就打開了電視，翹首以待神舟六號回家。朱勇說：“神六返回艙的成功著陸，對我們內蒙古人民而言意義深刻。我為我們的祖國驕傲，為航天英雄喝彩！”在呼和浩特市社區工作的張威表示：“我們也要發揚載人航天精神，壹心壹意地做好本職工作，為國家經濟社會的發展盡心竭力。”
自神舟六號飛船發射升空以來，新疆幹部群眾積極收看、收聽和閱讀各類媒體對飛船運行情況的報道。在烏魯木齊紅山附近的壹處建築工地，42歲的新疆建工集團建築工人馮超告訴記者，工友們從收音機裏得知神舟六號成功返回、兩名宇航員勝利歸來的消息，頓時歡騰起來。他說，這是我們國家的驕傲，是每個中國人的驕傲。作為壹名建築工人，我壹定要幹好自己的本職工作，為國家更加強大貢獻力量。