選擇底本。這不是整理古籍的方法而只是整理的壹個工序，但在所有工序中是最主要的、起決定作用的工序。古籍不論用哪種方法來整理，都必須盡可能選擇好底本。而選擇好底本，又需要具備多方面的學問。
影印：這是整理古籍的壹種方法。由於具體影印是印刷廠的事情，有了底本就可以送印刷廠影印成書，所以有些人把它看得很簡單。其實，光選擇底本這件事就需要不少學問，有些影印本還要加標點，附校記，做索引，就更不容易了。
校勘：這是整理古籍的壹種方法和工序，而且是壹種重要的、最常用的方法和必備的工序。除非找到古籍的原稿寫定本，可以不必再作校勘外，要整理古籍就少不了做校勘。有時影印本也要做校勘附校記。同時，校勘這個工作做起來比較繁難，需要用上各種學問，因此要做好也最不容易。
輯佚：這是整理古籍的壹種方法。是從類書、古註以及《永樂大典》中把已經佚失的古籍搜輯出來，雖不能恢復該古籍的全貌，至少能起豹窺壹斑的作用。有些從《永樂大典》中搜輯的，還可以大體接近全貌。當然這不是整理古籍常用的方法，整理現存的古籍除發現有佚篇佚文外，就用不到輯佚。
標點：這是整理古籍的壹種方法和工序，而且和校勘壹樣也是常用的方法和必備的工序。不僅新整理出版的古籍都得施加標點，有些古籍影印時也得加上標點。標點這個工作，看起來比校勘簡單壹些，其實也需要學問，要做好並不容易。
註釋：這是整理古籍的壹種方法，但並不是常用的方法。有的古籍並不需要註釋，有的已有合用的舊註釋就不需要再做新註釋，還有的分量太大而不可能作註釋。註釋當然要有學問，做出高水平的註釋比自己寫書更不容易。
今譯：這是整理古籍的壹種方法，在某種意義上可說是註釋工作的延續。要作今譯的古籍比要註釋的為數更少，其難度則並不亞於作註釋。
索引：這是整理古籍的壹種方法和工序，但不是常用的方法和必備的工序。有些索引附在古籍原書之後，有的則可脫離原書獨立成冊。有的索引做起來比較簡單，有的則極為繁難，必須具有專門學問方能勝任。當今又有使用計算機技術編制古籍索引和全文數據庫的，已取得可喜的成績。
序跋：這不是整理古籍的方法而是整理的壹個工序，但任何古籍在整理後都少不了這個撰寫序跋的工序。當然，只有在做好其他工序的基礎上才有可能寫出好序跋，但真正要寫出好序跋，還得有更多的學問。
附錄：這也不是整理古籍的方法而是整理的壹個工序。有些古籍本來有附錄，有些雖無附錄，但有許多有用的材料可收集起來編成附錄。如何收集、如何編都有講究，不可等閑視之。
古籍整理的方法、工序壹***有以上十項。古籍整理工作說具體點是要做這十項工作，或者可以說，這十項工作構成了古籍整理工作的全部內容。 壹些珍貴的古籍善本，若沾上各種汙漬將大大影響該書的收藏價值。因此，對各種不同的汙漬應采用不同的除汙方法，現簡介如下，不妨壹試：
除黴斑。用棉花球蘸上氨水或明礬水，輕輕地在書頁的黴斑上擦拭，至除凈後再用吸水紙吸幹；也可用水和高錳酸鉀沖濃汁，用毛筆將濃汁塗在黴斑處，等五六分鐘後再用草酸水塗之，並用毛筆輕輕擦拭，如此數次能去除黴斑，最後用棉花球蘸上清水擦凈。
除墨漬字跡。在染有墨漬字跡的書頁下邊，先墊壹張吸水紙，再用20%的雙氧水溶液或高錳酸鉀溶液浸濕汙跡，然後在書頁上邊放壹張吸水紙，並壓上重物，等幹後墨水跡就會消失。如果用高錳酸鉀溶液時留有褐斑，可以再用草酸或檸檬酸溶液除去。若書頁上僅有壹些字跡也可用褪色靈塗之即可。
除臟手指印。先用肥皂蹭去手指印，再用濕布擦去肥皂跡，最後在書頁間襯上吸水紙，把水吸幹；也可用棉花球蘸以溫水沖兌的洗衣粉或洗潔精液輕輕擦拭，再用清水擦洗，最後將水分吸幹。
除油跡。在油跡上放壹張吸水紙，用熨鬥輕輕地熨幾遍，便可以把油分吸盡；也可用棉花球沾少許汽油或酒精輕輕擦除。
除蒼蠅便跡和蚊蟲汙跡。用棉花球蘸上醋液或酒精，在蒼蠅便跡和蚊蟲汙跡上輕輕擦拭，至除凈汙跡為止。
對於書籍上其他的壹般汙跡，只要用肥皂細心地擦拭，再用幹凈濕布輕輕抹凈，然後在書頁襯上吸水紙吸幹水分，就基本上可以獲得整舊如新的效果。 保存古籍我們壹定要忌用化學膠水、化學漿糊、玻璃膠紙等修補古籍。
中國古籍的紙張，多采用天然原料的手工制紙，而現今通用的化學膠水、化學漿糊及玻璃膠紙對中國式紙張具有極強的腐蝕力，壹般不隔多時，便會使紙張變質黃脆，觸手即碎，故而絕不可用。正確方法應為采用天然面粉漿糊，調以麝香、花椒，可達到修復與避蟲雙重功能。如果藏家壹時無法具備以上條件，也應寧可暫時不修，待請到行家裏手，再行修復，絕不可倉促濫修，加厄典籍。
忌用洋紙夾襯古籍。
許多民國版本的拓片、字帖、紙墨拓工皆屬精良，可版面之上卻是黃斑累累，令人扼腕。這是因為民國時期的壹些書賈作坊，貪求省惜工料費用，采用了壹種叫做“油光紙”的紙張（當時流行的壹種廉價的西式工業法制紙），作為字帖的襯紙。由於西式紙酸堿性不合量，具有壹定腐蝕力，以致許多民國舊帖慘遭“黃斑之厄”。這壹遺憾也使得當今的古籍藏家得出了壹條教訓，即：中國古籍必須遠離壹切西式紙張，二者隔離，方為上策。
忌用化學殺蟲劑防殺蠹蟲。
壹些新手藏書家，因為懼怕蠹蟲蛀毀古籍，便時常使用壹些化學殺蟲劑噴灑書櫥，結果蠹蟲猖獗如故，而古籍卻反遭其害，黃斑遍布書身。慘痛之余，古籍藏家們也悟出壹點，傳統古籍的紙張極為“嬌貴”，受不得任何化學品的侵害，而化學殺蟲劑的腐蝕只會造成“愛而毀之”的結果。傳統的正確防蟲方法應為：在書櫥中放置麝香、蕓香或花椒（也可采用質量上乘的印度奇南香），以香氣驅殺蠹蟲，效果極佳。