朱砂有鎮靜催眠作用，認識不壹致；它具有解毒和防腐的作用；外用可抑制或殺死皮膚細菌和寄生蟲。朱砂是汞的化合物，汞與蛋白質中的巰基有特殊的親和力。高濃度時能抑制多種酶和活性。進入體內的汞主要分布在肝臟和腎臟，造成肝腎損害，並可通過血腦屏障直接損害中樞神經系統。