商務印書館1897成立於上海，1954遷至北京。
中國商務印書館創辦於1980年6月，前身為“外貿出版社”，1983年4月更名為“中國對外經濟貿易出版社”，2003年9月改為“中國商務印書館”。
第二，運作方式不同
商務印書館是公私合營:新中國成立後，商務印書館積極完成公私合營的轉變，1954遷至北京，在中央的大力支持下開始了新的奮鬥。
中國商業出版社是商務部下屬的中央企業:中國商業出版社(原中國對外經濟貿易出版社)是中華人民共和國商務部下屬的中央出版社。
第三，主營業務不同
商務印書館的主要業務包括參考書、譯著、學術著作、科技圖書和教育期刊。
中國商務出版社出版國內外貿易和國際經濟合作方面的書籍和譯著；國內外貿易和國際經濟合作的文獻、資料、統計、工具書及相關的通俗讀物；商務系統職工政治思想教育、職業道德和業務培訓教材，商務院校教材和教材。
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