福建省圖書館藏書，自1906年以來，經過近百年的匯入、搜購、捐贈、接收，成為福建省最大的圖書館。其主要來源有福州在和正誼、致用、鏊峰、鳳池四書院，福州藏書樓、福州閱書社藏書，螺洲陳寶琛藏書，崇安潘氏、福州郭氏藏書，龔氏大通樓藏書，惠安陳念庭和孫經藏書，莆田康爵冰寄廬藏書，左海林石廬金石版本，沈氏 齋藏書以及烏山圖書館藏書和其他私家藏書（如陳文濤、張祥雲、陳紹寬等），還有傅家 、石景宜等和美國俄勒岡州的贈書。六十年代初，發現、鑒定、校勘、收藏抄本《榴花夢》。據1987年統計，古籍文獻22376種，其中經部1073種，史部5790種，子部5203種，集部8273種，叢部2037種。善本4080部，20286冊， 占福建全省現藏古籍善本50%以上。其中元刻本《方輿勝攬》、明刻本《李氏東書》、清刻本《臺灣府誌》、《靖海紀》（木活字本）、《金薯傳習錄》、清抄本《福建海關資料匯鈔》，以及徐勃、謝章鋌、曹學全、鄭傑、陳寶琛、沈祖牟等的批校題跋本。除歷代珍貴文獻、金石拓片之外，還入藏21種外文文種出版物，以英、俄、日為多。重點是電子、機械、化工、輕紡、農林水產、醫學、海洋、造船等類圖書。八、九十年代重點收藏各地文史資料統計資料和譜牒等地方文獻。形成以福建資料、地方誌、閩人著述、文史資料、譜牒等地方特色的信息資源庫。
據全國文獻資源調查1987年12月統計的數據，福建省圖書館藏總文獻量在全國居第26位，期刊收藏總量居全國第32位，自然科學文獻收藏量居第28位。在省級公***圖書館中文獻收藏量第15位。古籍文獻收藏量居全國第28位，善本收藏量全國第11位。而臺灣研究、福建研究、周易研究、中國近代史研究達研究級學科文獻水平。