2001.2，《梁啟超研究叢稿》，臺灣學生書局，407頁。
2005.12，《梁啟超的古書辯偽學》（收在《古典文獻研究輯刊·初編》第21冊），臺北花木蘭文化出版社，92頁。
2007.4，《數風流人物》，臺北秀威資訊公司，160頁。－梁啟超、徐誌摩、陳獨秀、雷震
2009.2，《書評寫作方法與實踐》，臺灣秀威圖書公司。
2010年6月第1版，《歷史的另壹角落－－檔案文獻與歷史研究》 商務印書館 。
（即出），《藝道情：王慶余大師口述傳奇的壹生》 2008.2，〈檔案、校勘與歷史真相：以黃彰健著《二二八事件真相考證稿》為例〉，《海峽評論》，第206期，頁57-64。
2007.12，〈晚清滿漢沖突與省籍情結：以試釋王湘綺〈督撫歌〉為中心的觀察〉，《儒藏論壇》第二輯，頁420-438。
2003.7，〈讀國防部檔案選輯“雷震案史料匯編”〉，《古今論衡》第9期，頁125-142。
2002.07，〈臺靜農先生珍藏陳獨秀手劄的文獻價值〉，《古今論衡》第8期，頁18-41。
2002.3，〈關於蔡松坡史料二三事─首次公布梁啟超親筆文稿〉，《書目季刊》第35卷第4期，頁59-65。
2000.6，〈北京大學收藏‘梁啟超給蹇季常等書信’書後─兼談書信的文獻價值〉，《書目季刊》第34卷第1期，頁83-97。
1998.3，〈君子合而不同─記熊十力與馬壹浮的壹次沖突〉，《中國文哲研究通訊》第8卷第1期，頁119-126。
1997.6，〈梁任公先生與飲冰室收藏書籍題跋〉，《國家圖書館館刊》第86卷第1期，頁227-244。
1997.5，〈困勉誌大人之學─曾文正對梁任公的影響〉，《鵝湖》第22卷第11期，頁32-36。
1996.3，〈壹篇湮沒七十余載的重要佚文─首次發表‘梁啟超對於順天時報啟事’原稿〉，《北京大學學報》(哲學社會科學版)第33卷第2期，頁87-90。 吳銘能。1995.12，〈梁啟超對國學的新解─兼談梁氏肯定中國文化價值的心路歷程〉，《鵝湖》第21卷第6期，頁49-56。 2005年11月4-5日，〈從中研院近代史研究所“口述歷史”文字之更動見歷史研究的若幹問題─以高雄地區二二八事件為例〉，中央研究院近代史研究所主辦，“記憶載體與近代中國的認同建構”(Vehicles of Memory and the Construction of Modern Chinese Identities)學術研討會，16頁。
2004年12月16-17日，〈由“高中歷史課程綱要”之爭論見臺灣的認同危機〉，澳門大學社會及人文科學學院當代中國社會科學研究中心主辦，“國家認同與兩岸未來國際研討會”，10頁。
2004年6月29日，〈專明學術以濟天下─陳澧經學發微〉，中央研究院文哲所主辦，“廣東學者的經學研究第壹次學術研討會”，18頁。
2003年11月28日，〈論王湘綺論章實齋〉，淡江大學、漢學研究中心合辦，“第四屆文獻學術研討會─文獻的學理與應用”。收在陳仕華主編、林惠珍編輯《章學誠研究論叢：第四屆中國文獻學學術研討會論文集》，臺北：臺灣學生書局，2005年2月，頁243-280。
2001年5月3-4日，〈五四新文化運動壹代表性刊物《新潮》之研究〉，收在郝斌、歐陽哲生主編《五四運動與二十世紀的中國：北京大學紀念五四運動80周年國際學術研討會論文集》，北京 : 社會科學文獻出版社，頁-。
1999年11月19-21日，〈梁啟超清代學術史述評〉，收在國立中山大學清代學術研究中心編《清代學術論叢》第三輯，頁421-452。
專題研究之壹部分
2003.8，〈臺靜農先生珍藏陳獨秀手劄的文獻價值〉，《陳獨秀研究》第二輯，合肥：安徽大學出版社，安徽大學陳獨秀研究中心、安徽省陳獨秀研究會編，頁158-192。 2007.7，〈讀沈津《顧廷龍年譜》〉，《古今論衡》，第16期，頁161-178。
2004秋季，〈歸骨於田橫之島─評王泛森著Fu Ssu-nien: A Life in Chinese History and Politics〉，《九州島學林》第2卷第3期(總5輯)，頁370-379。
2003.6，〈評沈津著“翁方綱年譜”〉，《漢學研究》第21卷第1期，頁461-467。
2001.6，〈評劉達臨著《中國性史圖鑒》〉，《漢學研究》第19卷第1期，頁427-434。
張錦郎、吳銘能。2001.3，〈評介辛廣偉著《臺灣出版史》〉，《書目季刊》第34卷第4期，頁63-87。
1999.12，〈沈津著《美國哈佛大學哈佛燕京圖書館中文善本書誌》校讀書後〉，《國家圖書館館刊》第88卷第2期，頁65-76。
1999.6，〈《北京大學圖書館藏善本書錄》讀後記〉，《古今論衡》第2期，頁97-103。
1996.5，〈學術的良知與嚴謹─梁啟超“年譜”和“手跡”校讀感言〉，《北京大學學報》(哲學社會科學版)第33卷第3期，頁26-28。 2006.12，〈把四川大學古籍所建設成宋代文獻資料中心：曾棗莊教授談《全宋文》編纂經過〉，《國文天地》第259期，頁102-106。
2006.7，〈豈僅僅是壹張文憑而已－臺灣不承認大陸學歷的分析〉，《海峽評論》第187期，頁37-39。
2006.3，〈沈津著《翁方綱年譜》暨輯《翁方綱題跋手劄集錄》補遺〉，《中國文哲研究通訊》第16卷第1期，頁129-151。
2005.6，〈廣東學術文化遺址考察記〉，《中國文哲研究通訊》第15卷第2期，73-93頁。
2005.1，〈評民進黨族群多元國家壹體決議文〉，《二十壹世紀》網絡版總34期。
2005.1，〈少了逗點 大有不同─陳獨秀自傳寫作日期辨正〉，《明報月刊》第四十卷第壹期，頁18-19。
2004.3，〈晚清“湖湘經學研究”座談會紀錄〉，《中國文哲研究通訊》第14卷第1期，頁3-42。
2003.9，〈“臺靜農先生珍藏書劄(壹)試讀(下)”〉(附：《臺靜農先生珍藏書劄(壹)》試讀後記)，《中國文哲研究通訊》第13卷第3期，頁171-201。
2003.6，〈“臺靜農先生珍藏書劄(壹)試讀(中)”〉，《中國文哲研究通訊》第13卷第2期，頁245-272。
2003.3，〈“臺靜農先生珍藏書劄(壹)試讀(上)”〉，《中國文哲研究通訊》第13卷第1期，頁141-191。
2002.8，〈關於陳獨秀自傳寫作時日辨正〉，《歷史月刊》第175期，頁113。
1997.10，〈今本《飲冰室合集》未收梁任公文字知見舉要〉，《梁啟超研究》第13期，廣東：新會市梁啟超研究會編印。