為了防備來自帝國內部的威脅，叛教時代之後，異端審判庭被組建，雖然審判庭監視著帝國內外的壹切動向，但異端審判庭和獵巫人們關註的主要方面是對無約束的靈能者、異教徒和變種人的揭發和裁決，由於修女會和新成立的異端審判庭的目標緊密交織，不久之後，兩者便投身於為同壹神聖目的而奮戰的行列中並結成同盟，修女會作為國教永久的常備部隊，同時也成為異端審判庭的下屬武裝。
作為壹個已然存在的秘密組織的黑暗分支，異端審判庭是人性的守護者，人類的監護人，防範著對帝國危害不亞於外部威脅的內在軟弱。異端審判庭的獵巫人都是令人畏懼的鐵腕角色，或因長期呆在審判庭要塞的拷問室裏而皮膚蒼白，或連續數周不知疲倦的研讀記載異教徒及其詭計的古籍。
壹個異端審判庭審判官的來臨不僅僅伴隨著敬畏，還有同等分量的恐懼，因為沒人知道他們的目光會落於什麽地方以及疑心會降於什麽人身上。
除了監視國教—— 確保帝國信徒們在信仰之戰中沒有逾越所授與的所有權利，以及樞機主教們沒有獲得過多的權利 -——異端審判庭還註視著帝國的許多其他組織：法務部，帝國軍隊，星際陸戰隊以及審判庭的同僚們，他們監護著思想和肉體的純凈，沒有任何人能夠例外,那些膽敢阻攔在獵巫人面前的人只能用勇敢來形容了，因為僅僅反抗壹位異端審判庭的成員便可能被指控為異教徒和異端。
修女會
在叛教時代末期，修女會隨著塞巴斯蒂安 索爾對國教的重組而隆重登場，帝王之女被分為兩個部分：位於地球的隱修會和位於奧菲利亞 VII的聖修院。