浙江大學科研機構根據其批準設立的主體不同，分為三類，包括政府批準機構、學校自主批建機構和學校與校外獨立法人單位聯合***建機構。截至2012年4月16日，浙江大學正在運行的科研機構***307個。截至2015年6月，浙大設有16個直屬研究院，2個直屬研究中心，1個直屬研究所，1個直屬研究基礎平臺 。 國家重點實驗室 矽材料國家重點實驗室
計算機輔助設計與圖形學國家重點實驗室
流體動力與機電系統國家重點實驗室
工業控制技術國家重點實驗室
現代光學儀器國家重點實驗室
化學工程聯合國家重點實驗室（聯合）
植物生理學與生物化學國家重點實驗室（聯合）
水稻生物學國家重點實驗室（聯合）
能源清潔利用國家重點實驗室
傳染病診治國家重點實驗室 國家工程實驗室 生物飼料安全與汙染防控國家工程實驗室 國家專業實驗室 二次資源化工國家專業實驗室
電力電子技術國家專業實驗室
生物傳感器技術國家專業實驗室
工業心理學國家專業實驗室 國家工程（技術）研究中心 工業自動化國家工程研究中心
電力電子應用技術國家工程研究中心
國家光學儀器工程技術研究中心
國家電液控制工程技術研究中心
國家水煤漿工程技術研究中心浙江大學燃燒技術研究所
國際科技合作重點科研機構（聯合研發中心）
浙江國際納米技術研發中心 教育部重點實驗室及工程研究中心 生物醫學工程教育部重點實驗室
瀕危動植物保護生物學教育部重點實驗室
動物分子營養學教育部重點實驗室
汙染環境修復與生態健康教育部重點實驗室
視覺感知教育部-微軟重點實驗室
高分子合成與功能構造教育部重點實驗室
軟弱土與環境土工教育部重點實驗室
惡性腫瘤預警與幹預教育部重點實驗室
生殖遺傳教育部重點實驗室
膜與水處理技術教育部工程研究中心
嵌入式系統教育部工程研究中心
計算機輔助產品創新設計教育部工程研究中心
表面與結構改性無機功能材料教育部工程研究中心
數字圖書館教育部工程研究中心
高壓過程裝備與安全教育部工程研究中心 其他中央部委實驗室及研究中心 農業部核農學重點開放實驗室
農業部動物營養與飼料（華東）重點開放實驗室
農業部農業環境工程與智能化設備重點開放實驗室
農業部園藝植物生長發育與品質調控重點開放實驗室
農業部動物疫病病原學與免疫控制重點開放實驗室
農業部面源汙染控制重點開放實驗室
農業部作物病蟲分子生物學重點開放實驗室
衛生部傳染病重點實驗室
衛生部多器官聯合移植研究重點實驗室
衛生部醫學神經生物學重點實驗室
國家藥品監督管理局藥品評價中心浙江呼吸藥物研究重點實驗室
智能科學與技術網上合作研究中心（教育部網上合作研究中心）
國家瀕危野生動植物種質基因保護中心（教育部、國家林業局）
教育部含油氣盆地構造研究中心
磁約束核聚變教育部研究中心（聯合）
國家環境保護燃煤大氣汙染控制工程技術中心（環保部） 自主設立基地 浙江大學研究所（155）、浙江大學交叉研究中心（16）
聯合***建基地 與國外單位聯合科研機構（40）、與國內企事業單位聯合科研機構 校設科研機構 類別名稱主頁研究中心數學科學研究中心 舟山海洋研究中心 研究所遺傳學研究所 研究基礎平臺社會科學研究基礎平臺 研究院（理工農醫類） 生命科學研究院 可持續能源研究院 浙江加州國際納米技術研究院 國際設計研究院 水環境研究院 轉化醫學研究院 求是高等研究院 研究院（人文類）文化遺產研究院 國際影視發展研究院 研究院（社科類） 中國農村發展研究院 中國西部發展研究院 金融研究院 國際創新研究院 全球浙商研究院 公***政策研究院 研究院（異地類）臺州研究院 2012年，浙江大學科研總經費達到30.78億元（比上年增長9.3%），科研項目達到千萬級以上的有107項，億級項目10余個。
2012年浙江大學獲批準國家自然科學基金項目794項，經費5.6億元。承擔國家“973計劃”項目6項、重大科學研究計劃項目1項、國家自然科學基金重大項目1項。新增創新研究群體基金項目2個、教育部創新團隊1個、學科創新引智基地1個。
2012年，浙江大學人文社科科研經費達到2.06億元。獲批國家社科基金重大招標基金6項、重點項目3項、基金項目27項，教育部重大課題攻關項目2項。
2012年，浙江大學榮獲國家科學技術獎勵13項，獲得國家科技進步獎壹等獎1項，二等獎4項；國家技術發明獎二等獎1項。
根據ESI公布的數據，截至2013年1月1日，浙江大學十年累計引文居世界學術機構排名第195名，較去年同期上升了36位，進入世界前1%的學科達到14個，其中農業科學、化學、計算機科學、工程、材料科學、藥學與藥理學、植物與動物科學等7個學科進入世界前100名，農業科學、化學、材料科學等3個學科進入世界前50名。
根據中信所2012年公布的統計數據，浙江大學2011年SCI收錄的Article、Review兩類論文***計4215篇，比上年增長9.5%；EI收錄論文3325篇，比上年增長0.1%；“表現不俗”論文數1449篇，比上年增長68.5%；入選最具國際影響的學術論文3篇。
SSCI收錄論文245篇，比上年增長35%；A&HCI收錄論文25篇，比上年增長39%。獲得第六屆教育部“高等學校優秀成果獎（人文社會科學）”29項，其中壹等獎壹項。
獲授權專利2244件，比上年增長17.2%，其中授權發明專利1515件，比上年增長22.8%。參與起草國家標準7項。登記計算機軟件著作190件。 館藏資源
截至2014年底，浙江大學圖書館實體館藏總量已達574.3萬冊，包括線裝古籍18萬余冊。“浙大文庫”收集本校教職工和校友著作以及 浙大出版的期刊約1萬余冊。***訂購各類文獻數據庫400余個，中外文電子圖書170萬余種，中外文電子期刊79480種 。
學術期刊
《浙江大學學報》由浙江大學學報（英文版）A輯：應用物理與工程、浙江大學學報（英文版），B輯：生物醫學和生物技術、信息與電子工程前沿（英文）、浙江大學學報（人文社會科學版）、浙江大學學報（工學版）、浙江大學學報（理學版）、浙江大學學報（農業與生命科學版）、浙江大學學報（醫學版）組成。
《高等學校化學工程學報》：中文雙月刊，1986年創刊。是中國化學工程與技術學科最重要的學術期刊之壹，被美國《工程索引》（EI Compendex）、美國《化學文摘》（CA）、俄羅斯《文摘雜誌》（AJ）、英國皇家化學會《化學工程文摘》、中國科學院《中國科學引文索引》、中國化工信息中心《中國化學化工文摘》、《萬方數據庫》等檢索機構收錄。
《工程設計學報》：中文雙月刊，1994年創刊。內容為工程設計領域及其新興交叉學科領域具有創新性和前沿性的高水平基礎研究、應用研究的科研成果。是美國《劍橋科學文摘（工程技術）》（CSA（T））、波蘭《哥白尼索引》（IC）、“中國科學引文數據庫（CSCD-E）”等國內外多家數據庫的來源期刊，入選《中文核心期刊要目總覽》2004年版、2008年版核心期刊 。 浙江大學積極開展國際交流與合作。截至2013年，學校已與26個國家和地區的100多所大學建立了校際關系，通過這些校際關系，開展了各種各樣的交流活動和合作項目，既有學生和教師的交流，又有聯合舉辦的國際會議、聯合開展的合作項目及聯合培養的研究生。
浙江大學每年都會有數百名海內外政要、專家學者和知名企業家來校交流訪問、講學及研究。德國總統羅曼·赫爾佐克 ，聯合國秘書長科菲·安南，聯合國教科文組織總幹事伊琳娜·博科娃，英國劍橋大學著名學者斯蒂芬·威廉·霍金及楊振寧，李政道，丁肇中，穆拉德，威廉·夏普，羅伯特·恩格爾，麥克德爾米德，Harold Kroto等眾多諾貝爾獎得主都曾到訪過浙江大學。僅2012年，浙大舉辦國際會議79個，聘請長、短期外國文教專家532名，其中包括4位諾貝爾獎獲得者。聘請30位海外知名教授擔任浙大名譽教授、客座教授，其中包括2位諾貝爾獎獲得者。並與15所世界著名大學新簽或續簽校際合作協議。
浙江大學每年也派出數百名教師出國及赴港澳臺地區講學、進修，合作研究或參加國際會議。2012年全校師生海外學習交流總數達到6328人次，其中，教職工赴海外學習交流總數達到2847人次；學生赴海外學習交流項目總數達到3481人次。
浙江大學通過進行國際及雙邊會議，使學校師生了解最前沿的學術成果和信息。浙江大學與日本及歐洲的大學之間的學生交流較頻繁，既有學生的長期交流計劃，又有短期的交換項目，如歐洲商務實習項目、香港實習項目、愛因斯特交流項目以及世界著名的melten項目。