古代丹家的藥性論，即對物質問相互作用的認識，是以陰陽五行學說為理論基礎的。《周易參同契》在闡明陰陽學說時便認為：萬物的產生和變化都是由陰與陽的彼此交媾，相須不離，使精氣得以舒發的結果。唐代張九垓的《張真人金石靈砂論》則進壹步把陰陽學說具體化，說明這壹學說怎樣指導金丹術。他說：“大道沖融而包天地，驅策陰陽，成乎宇宙。天形陽而左旋，地質陰而右轉，日為陽精而晝行，月為陰靈而夜流。……壹陰壹陽曰道。聖人法陰陽，奪造化，故陽藥有七，金二石五，黃金、白銀、雄、雌、砒黃、曾青、石硫黃皆陽藥也；陰藥有七，金三石四，水銀、黑鉛、硝石、樸消皆屬陰藥也。陰陽之藥各稟其性而服之，所以有度世之期，不死之理者也。”又說：“還丹者，取陰陽之精，法天地造化之功，水火相濟，自無入有，以成其形。豈若砂汞，孤陰為體，無陽配生，不能合四象，運五行，所以孤陰不育，寡陽不生，陰陽配合，方成還丹。”