新疆大學圖書館有工作人員 107人，分別由漢、維吾爾、哈薩克、烏孜別克、回、滿等民族組成，少數民族工作人員47人，占全館總人數43%；全館工作人員中，高級職稱17人，中級職稱49人。圖書館設館長壹名,黨總支書記兼副館長壹名，副館長3名，下設行政辦公室、流通部、期刊部、信息服務中心、Calis新疆維吾爾自治區文獻信息服務中心辦公室、古籍與地方文獻部、采編部、技術部。
新疆大學圖書館自動化管理系統使用的是江蘇匯文軟件有限公司研發的“匯文文獻信息服務系統”，是壹種基於大型圖書館管理模式，采用分館、總館二層網絡體系結構模式，采用大型Oracle關系數據庫管理系統。該系統包括采訪、編目、流通、期刊管理、公***查詢、系統管理、OPAC查詢和Z39.50***八個模塊，可以對圖書館日常業務工作進行全面細致的管理。