秦始皇的焚書坑儒，決沒有破壞那些有價值的書籍，而是鹹陽城有些“術士”，這些人聽說秦始皇在尋找關於延長壽命的方法，於是他們就寫了壹些諷刺秦始皇的書，這可是侮辱皇帝的標準死罪啊！秦始皇能不殺他們嗎？能不把那些汙蔑他的書籍燒掉嗎？之後幸存的壹些術士，自然就把秦始皇描寫成了迫害文人的暴君。
秦始皇不但沒幹過損害古籍文獻的壞事，反而保護了不少文獻書籍。比如“六國的國史書籍”，秦始皇曾派人精心收藏了起來。
六國被滅後，秦始皇下令搞“文禁”，不許老百姓私自收藏六國的史書，只許官方收藏，並未因六國曾經是敵人就毀掉他們的史書，秦始皇考慮到這是歷史記載，對歷史要負責，所以說秦始皇還是比較英明的，不是傳說中的那種暴君人物。
所以說秦始皇對古籍文獻不曾有過損害。
乾隆修《四庫全書》，因思想偏見太深，刪去了很多珍貴內容，對古籍文獻損害巨大。《四庫全書》是乾隆親自組織人修訂的，期間用了10年才完成。
1、因乾隆思想過於封建，他認為只有儒家的內容，值得留存在四庫全書中，那些西方的科技內容屬於“異端邪說”，可以學習他們的技術，但不能把內容學說記錄到四庫書籍中。
2、乾隆只允許把少量的農業、醫學、天文類科技學說，留存在四庫全書中，其它科技學說壹概刪除不留。
3、乾隆不允許把戲曲、小說類的文藝內容留存在四庫全書中。
4、四庫全書的部分圖文內容，有被刪掉或被篡改過。
乾隆的這種封建愚昧思想，可以說嚴重影響了中國的發展進程，難怪清朝末年我們與西方的差距那麽大，乾隆對此事貢獻不小啊！
從以上的對比可以看出，秦始皇的焚書坑儒與乾隆的修四庫全書，很明顯誰才是損害過古籍文獻的兇手。