書上說他是被曹操殺死的。
《後漢書》和《三國誌》都說華佗年近百，卻依然保持著剛強的樣子。《後漢書》甚至說“人自以為神仙”。
漢代以後，中醫作家很少提及此人。晁的《隋代病源論》和李時珍的《本草綱目》都沒有提到這個人。宋代學者甚至對此提出質疑。
現代國學大師陳寅恪認為，華佗本身就是壹個童話，華佗的古音接近印度的“嘎達”，意為“藥神”。所以，“當時民間依附於印度神話，因為叫華佗，實際上是把它當成了藥。”而且他的案件原型來自印度佛教傳說，“是神話般的，似乎是可疑的。”。這個故事和曹沖大象壹樣，是印度舶來品。華佗可能是真人，但他的醫學傳奇是虛構的。