上學前是1955創辦的山東省中醫學院研究班和1956創辦的山東省中醫進修學校。1958經山東省人民委員會批準成立山東中醫學院。1996,經國家教委批準更名為山東中醫藥大學。
學校有三個校區,總占地面積2000多畝,建築面積53.9萬平方米。圖書館擁有紙質圖書203.9萬冊,電子圖書79.7萬冊,珍本圖書近3萬冊。現有教學機構17個,科研機構5個,輔助教學機構4個,其中直屬醫院3個,非直屬醫院20個,教學醫院22個。現有33個本科專業,3個博士後科研流動站,3個壹級學科博士學位授權點,15個二級學科博士學位授權點,9個壹級學科碩士學位授權點,46個二級學科碩士學位授權點。