1939年2月，竺可楨校長來到貴陽，與當時的貴州省主席吳鼎昌商議，準備把浙大遷到雲南的建水或貴州的安順，在商議過程中，恰遇湄潭在貴陽做事的陳世賢、宋麟生兩人，他們力勸竺校長遷往湄潭，因為湄潭山清水秀、價廉物美，人民感情淳樸。竺校長聽了兩人的介紹後，遂來湄潭考察。時任湄潭縣縣長的嚴溥泉在江蘇任過職，聽說竺校長來湄考察很高興，親自召集各界人士組織了21個團體，對竺校長的到來表示隆重的歡迎，並告訴竺校長把湄潭最好的房舍供浙大師生選用，竺校長在湄考察壹天後，在日記中寫道：湄潭風景優美，民風淳樸，物美價廉。決定了將浙大遷到湄潭。
1940年1月16日，竺可楨從貴陽抵遵義，受到全城紳士的歡迎。因遵義至湄潭的公路還有部分路面和橋梁未竣工，遷到遵義的浙大只好臨時安排房舍復課，同時派理學院院長胡剛復、農學院院長蔡邦華到湄潭籌劃遷校事宜，6月，浙大農學院師生陸續遷到湄潭，6月10日正式開學上課。9月22日，竺校長偕胡剛復、費鞏教授來湄，次日到城北20公裏的永興場，察看了江西會館、三楚會館、四川會館、南華宮等處，決定將滯留在貴陽青巖的壹年級遷到永興，理學院及師院理科速遷湄潭縣城，至此，浙江大學結束了兩年多顛沛流離的西遷之路，在貴州黔北找到了壹方適於教學科研的凈土，並在這裏紮根成長、開花、結果。由於浙大西遷的路線與紅軍長征時期前半段路線基本吻合，而落腳點又都是對中國革命具有轉折意義的遵義，因此人們稱它為“文軍的長征”。
湄潭為遵義浙大的分部，文學院、工學院、師範學院文科在遵義，理學院、農學院、師範學院理科在湄潭，壹年級分校在湄潭永興場。
戰時法幣貶值，物價飛漲，浙大學生因多來自淪陷區，經濟來源斷絕，靠公費、工讀維持生計，教職工壹家數口開支大，艱難度日。雖印刷條件和紙張及其困難，但學術期刊比戰前還多。逢著名科學家誕辰或有意義的節日，即有學術報告會。
此時浙大愛國力量蓬勃發展，本著“讀書不忘救國”，開展各種抗日活動，有黑白文藝社，拓荒社、塔外畫社、鐵犁劇團等。1943年成立“湄江吟社”，有錢琢如、蘇步青發起，結伴遊覽，吟詠頗多。或憂國憂民，或歌頌壯麗河山。
同時，體育操練亦生生不息，各處空地都已成為運動場。浙大附中與湄潭中學合並。浙大對當地學風產生重要影響，當地青年往常以經商和做官為前途，自此讀書風氣日濃。
生活、學習條件如此艱苦，但浙大西遷培養的1300多名學生中，湧現了不少如李政道、程開甲、谷超豪、施雅風、葉篤正等精英。據不完全統計，在當年浙大任教和求學的師生中，後來有50人當選兩院院士。李政道曾說，壹年的“求是”校風熏陶，發端了他幾十年細推物理之樂，給了他攀登世界高峰的中華文化底蘊。
浙江大學在遵義湄潭辦學七年，被稱為浙大歷史上最光輝的七年，是浙大辦學歷史上最重要的發展時期。在湄工作和學習過的兩院院士達45位，其中有壹大批中國知識分子的壹代精英，竺可楨、蘇步青、王淦昌、談家楨、貝時璋、盧鶴紱、陳建功等世界著名科學家的主要論文在湄潭成稿，他們在十分簡陋的條件下，潛心研究，孜孜以求，成就赫然。他們不僅為我國科學事業做出卓越的貢獻，還為貴州黔北以及湄潭政治、文化、經濟的發展起到巨大的影響和推動作用。