皇太極也以洪太極、黃臺吉 等名字在明末清初的文獻中出現。現代學者多認為皇太極並非其真實名字，而僅僅是其稱號，來源於蒙古貴族的稱號“渾臺吉”。
而皇太極的本名眾說紛紜。俄羅斯漢學家G.V.戈爾斯基認為“皇太極”的本名是“阿巴海”（Abakhai）。此說曾壹度被西方學界廣泛接受，但這個名字並沒有在當時的漢文和滿文文獻中登場，因此被認為是錯誤的； 很有可能系其稱號“天聰汗”的誤解。
在明代陳仁錫的《山海紀聞》裏，皇太極以“喝竿”的名字出現； 而在《朝鮮王朝實錄·仁祖實錄》中，皇太極以“黑還勃烈”的名字登場。 日本學者三田村泰助根據這兩種文獻，提出皇太極的本名大致讀作“Hekan”的說法。三田村泰助將《仁祖實錄》中的“黑還勃烈”還原為滿語“hekan beile”：“黑還”（hekan）是皇太極的本名；“勃烈”（beile）即“貝勒”，是滿洲貴族的壹種稱號。 排行姓名生卒年份生母封爵皇長子愛新覺羅·豪格1609-1647繼妃烏拉那拉氏肅武親王皇二子愛新覺羅·洛格1611-1621同皇長子幼殤皇三子愛新覺羅·洛博會1611-1617元妃鈕祜祿氏幼殤皇四子愛新覺羅·葉布舒1627-1690庶妃顏紮氏輔國公皇五子愛新覺羅·碩塞1629-1654側妃葉赫那拉氏承澤裕親王皇六子愛新覺羅·高塞1637-1670庶妃納喇氏鎮國愨厚公皇七子愛新覺羅·常舒1637-1699庶妃伊爾根覺羅氏輔國公皇八子（未命名）1637-1638敏惠恭和元妃博爾濟吉特氏幼殤皇九子愛新覺羅·福臨1638-1661孝莊文皇後博爾濟吉特氏清世祖章皇帝皇十子愛新覺羅·韜塞1639-1695庶妃克伊克勒氏輔國公皇十壹子愛新覺羅·博穆博果爾1642-1656懿靖大貴妃襄昭親王女 排行姓名生卒年份生母封號額駙皇長女-1621-1654繼妃烏拉那拉氏固倫敖漢公主敖漢·班第皇二女馬喀塔1625-1663孝端文皇後固倫溫莊公主孛兒只斤·額哲，孛兒只斤·阿布奈皇三女-1628-1686孝端文皇後固倫靖端長公主奇塔特皇四女雅圖1629-1678孝莊文皇後固倫雍穆公主弼爾塔哈爾皇五女阿圖1632-1700孝莊文皇後固倫淑慧長公主博爾濟吉特·索爾哈，博爾濟吉特·色布騰皇六女-1633-1649側妃紮魯特博爾濟吉特氏固倫公主誇劄皇七女-1633-1648孝莊文皇後固倫淑哲公主，謚固倫端獻長公主博爾濟吉特·鏗吉爾格皇八女-1634-1692孝端文皇後固倫永安長公主，謚固倫端貞公主博爾濟吉特·巴雅斯護朗皇十女-1635-1661庶妃納喇氏縣君瓜爾佳·輝塞皇十壹女-1636-1650懿靖大貴妃固倫端順長公主博爾濟吉特·噶爾瑪索諾木皇十二女-1637-1678庶妃賽音諾顏氏鄉君博爾濟吉特·班第皇十三女-1638-1657庶妃納喇氏無瓜爾佳·哈拉皇十四女-1641-1703庶妃奇壘氏和碩恪純長公主吳應熊養女-1615-1637克勤郡王嶽托嫡福晉哈達那拉氏和碩公主翰卓禮克圖巴敦臺吉