學術帶頭人:林雲教授學術團隊:朱永剛教授、趙、王立新教授、教授、教授等。
該研究方向致力於建立薄弱地區考古文化的年代順序和譜系關系；針對年代序列與譜系關系明確的地區，重點研究其文化經濟形態的演變及其動因，並對聚落形態進行分析，理清該地區古代社會的發展進程。該研究方向的綜合實力在國內高校同領域中牢牢處於領先地位。
2.高句麗與渤海考古
學術帶頭人:魏存成教授學術團隊:、彭、教授等。
本研究重點是高句麗和渤海考古，以及漢唐、遼、金、元時期的考古。高句麗和渤海考古是東北亞考古研究的熱點，也是本學科極具特色和影響力的研究方向。基礎研究與應用研究相結合，為中國集安成功申報高句麗世界文化遺產做出了突出貢獻。
3.體質人類學和生物考古學
學術帶頭人:朱宏教授學術團隊:周輝教授、陳全佳教授、唐教授、張全超講師。
該研究方向主要包括:①運用體質人類學的方法(該學科的古骨標本庫規模在國內高校首屈壹指)研究古人類群體的人口構成和人種誌類型劃分；②利用DNA方法(本學科有國內高校第壹個考古DNA研究的專門實驗室)對地下出土的古人類骨骼進行個體和家系鑒定，通過比較不同種群的遺傳異同，揭示它們在物種進化中的關系；(3)運用地學、植物學、動物學的研究方法，恢復古代人類的生存環境，從食物選擇、狩獵、畜牧等方面揭示古代居民經濟文化生活的概況，進而探討古代自然環境與各地區人類關系的內涵和模式；④利用古病理學方法研究古代人類群體的體質健康水平、飲食與生活方式、體質與自然環境的關系。這個方向的突出特點是文理交叉、相互滲透。具有傳統優勢的體質人類學研究和該方向新興的分子考古學研究在國內高校處於領先地位。
4.外國考古學
學術帶頭人:教授的學術團隊:滕明宇教授、馮恩學教授、副教授、陳副教授等。
該方向的研究致力於中國考古學與世界考古學的融合。主要包括以下幾個方面:①其他國家和地區古代文明及其起源的研究，主要是兩河流域史前和早期國家的研究；(2)中國周邊國家考古研究主要包括俄羅斯西伯利亞和遠東、蒙古、日本、朝鮮韓國、中亞國家；③對國外考古學理論和方法的發展進行系統的研究，從以上兩個方面獲取大量最新的國外考古學實例和研究動態。